若市场监督管理部门因食品中发现头发等异物，要求商家“退一赔三”但双方未协商一致，商家可按以下步骤处理：

1. 核实法律依据与事实基础
   根据《食品安全法》第148条，若食品存在“不符合安全标准”的情形（如混有异物），消费者有权要求支付价款十倍或损失三倍的赔偿（最低1000元）。市场监管部门提出“退一赔三”需以该条款为依据，商家应首先确认：

   • 涉事食品是否确实存在头发等异物（可通过监控录像、生产记录、第三方检测等证据自证清白）；
     
   • 头发是否属于“不符合安全标准”的范畴（司法实践中通常认定异物属于安全标准问题，但商家可主张异物系偶然混入且未造成实际危害，争取减轻责任）。
     

2. 与市场监管部门沟通协商

   • 主动提交证据：向监管部门提供生产流程规范、卫生检测报告、异物来源排查结果等材料，证明已尽到合理注意义务，降低主观过错程度；
     
   • 提出替代方案：若认可退还货款，但拒绝“赔三”，可建议通过调解降低赔偿比例（如“退一赔一”），或以赠送代金券、免费服务等方式补偿消费者；
     
   • 申请行政复议或听证：若监管部门坚持“退一赔三”且商家认为处罚过当，可在收到处罚决定书后60日内申请行政复议，或要求举行听证会陈述意见。
     

3. 应对消费者诉讼风险
   若消费者不接受调解方案并起诉，商家需在答辩中重点论证：

   • 异物来源非商家责任：如头发系消费者自身掉落（需结合监控、证人证言等）；
     
   • 未造成实际损害：消费者未因食用异物产生身体不适，主张“惩罚性赔偿”缺乏依据；
     
   • 已尽安全保障义务：提供食品生产、储存、销售环节的合规证明，证明自身无过错。
     

关键提醒：若商家确实存在过错（如生产环境脏乱导致异物混入），建议优先接受“退一赔三”以避免行政处罚升级（如罚款、停业整顿）。若对责任认定有异议，务必在法定期限内通过行政复议或诉讼程序维权，切勿忽视监管部门的正式通知。