取保候审12个月后案件的处理方式需根据案件具体进展及法律程序综合判断，核心结论如下：

1. 若案件已进入审查起诉或审判阶段
   根据《刑事诉讼法》第79条，取保候审最长不得超过12个月。若案件在12个月内已移送检察院审查起诉或法院审理，取保候审措施将依法解除，案件进入下一程序：

   • 审查起诉阶段：检察院需在1个月内作出是否起诉的决定（可延长15日）；
     
   • 审判阶段：法院需在受理后2个月内宣判（至迟不超过3个月，特殊情况可延长）。
     关键点：取保候审解除不等于案件终结，需持续关注司法机关的后续通知。

2. 若案件未移送审查起诉或审判
   若12个月内公安机关未完成侦查或未移送检察院，取保候审到期后应依法解除，并采取以下措施：

   • 撤销案件：根据《刑事诉讼法》第163条，公安机关需撤销案件并通知犯罪嫌疑人；
     
   • 变更强制措施：若证据不足但未达撤销条件，可能变更为监视居住或继续侦查（需重新办理手续）；
     
   • 无罪释放：若经审查无犯罪事实，应立即释放并出具释放证明。
     风险提示：若公安机关未依法处理，可向其上级或检察院申诉。

3. 特殊情形：案件被退回补充侦查
   若检察院将案件退回公安机关补充侦查，取保候审期限可重新计算（但总期限仍不得超过12个月）。此时需注意：

   • 补充侦查期限为1个月，以两次为限；
     
   • 若超期未重新取保，应自动解除强制措施。
     

实务建议：

• 取保候审到期前，主动联系办案机关（公安机关/检察院）确认案件进展；
  
• 保留取保候审决定书、保证金收据等文件，作为维权依据；
  
• 若遭遇超期羁押或违法解除，可依法申请国家赔偿或提起行政诉讼。
  

注：具体处理需结合案件性质、证据情况及司法机关效率综合判断，建议委托律师介入以保障权益。