当被告发现被原告诬告时，可以采取以下全面且系统的策略来维护自身合法权益：

1. 收集并保存证据：

   • 证据类型：这是应对诬告的基础。被告应全面收集与案件相关的所有证据，包括但不限于书面文件（如合同、协议、沟通记录等）、电子数据（如短信、邮件、聊天记录等）、实物样品（如相关物品、照片等）以及目击证人证言等。确保证据的真实性和完整性，以便在后续的法律程序中提供有力支持。
   • 获取方式：被告可以自行收集证据，也可以申请法院调查取证。特别是对于一些无法自行获取的关键证据，如银行账户信息、公安机关记录等，应及时向法院提出申请。
   • 时效性：证据的收集应尽早进行，以避免证据灭失或篡改。在发现被诬告后，被告应立即开始收集证据，并妥善保存。

2. 向公安机关报案：

   • 适用情形：如果原告的诬告行为涉嫌犯罪，如诬告陷害罪，被告应向公安机关报案。诬告陷害罪是指捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究，情节严重的行为。
   • 报案方式：被告可以书面或口头向公安机关提出报案，并提供相关证据材料。在报案时，应详细陈述被诬告的事实和经过，以及所掌握的证据情况。
   • 配合调查：在公安机关侦查过程中，被告应积极配合，提供线索和证据，协助公安机关查明事实真相。

3. 民事途径维权：

   • 提起反诉：如果原告的诬告行为给被告造成了直接经济损失，如律师费、差旅费等应诉费用，被告可以在本诉过程中提起反诉，要求原告赔偿这些损失。反诉应基于原告的诬告行为，且该行为与本诉有牵连关系。
   • 要求赔偿损失：除了直接经济损失外，如果原告的诬告行为还侵害了被告的名誉权等人格权益，给被告造成了精神损害，被告可以在本诉结束后另行向法院提起诉讼，要求原告承担侵权责任，包括停止侵害、恢复名誉、消除影响、赔礼道歉以及赔偿精神损害抚慰金等。

4. 司法程序中的辩护与应对：

   • 积极答辩：在法庭审理过程中，被告应认真倾听原告的陈述，对于原告诬告的内容，要及时、清晰、准确地进行反驳。被告应提供相关的证据线索或证据来支持自己的观点，以证明原告的指控是不实的。
   • 申请鉴定或专家辅助人出庭：如果案件涉及专业领域的问题，如笔迹鉴定、物证鉴定等，被告可以申请专业鉴定意见。同时，也可以邀请相关领域专家出庭，对专业问题进行解释和说明，以增强辩护力度。

5. 注意诉讼时效：

   • 民事诉讼时效一般为三年，被告应在诉讼时效内提起诉讼或反诉，以维护自身权益。如果超过诉讼时效，被告可能会丧失胜诉权。

6. 依法追究诬告者的法律责任：

   • 刑事责任：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，捏造事实诬告陷害他人，情节严重的，将面临刑事处罚。被告可以积极配合公安机关的侦查工作，提供必要的协助和证据，以追究原告的刑事责任。
   • 民事责任：通过诉讼方式要求原告承担赔礼道歉、赔偿损失等民事责任。这包括物质损失和精神损害赔偿两部分。被告应提供充分的证据证明自己的损失情况，以便法院作出公正的判决。

在处理此类纠纷时，被告应保持冷静和理智，避免采取过激的行为或言辞。同时，要尊重法院的判决结果。如果不服判决，被告可以依法提起上诉或者申请再审，但不得采取非法手段干扰司法程序的正常进行。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。