机动车检测机构只收费不检车的行为，主要由市场监督管理部门进行处罚。以下是对此问题的详细分析：

一、法律背景与依据

机动车检测机构作为提供专业检测服务的机构，其运营受到相关法律法规的严格监管。当检测机构出现只收费不检车等违规行为时，这直接违反了市场监管的相关规定，损害了消费者的合法权益。根据《中华人民共和国消费者权益保护法》以及《中华人民共和国产品质量法》等相关法律法规，市场监督管理部门有权对这类违规行为进行查处。

二、处罚主体与程序

1. 处罚主体：市场监督管理部门是负责监管市场秩序、保护消费者权益的主要部门。对于机动车检测机构的违规行为，市场监督管理部门有权进行调查、取证，并依据相关法律法规作出处罚决定。

2. 处罚程序：

   • 调查取证：市场监督管理部门在接到举报或发现违规行为后，会启动调查程序，收集相关证据，包括检测记录、收费凭证等。
   • 立案审查：在收集到足够证据后，市场监督管理部门会对案件进行立案审查，确定是否构成违规行为。
   • 处罚决定：如果确认检测机构存在违规行为，市场监督管理部门会依法作出处罚决定，包括罚款、责令整改、吊销营业执照等。

三、可能面临的法律后果

机动车检测机构如果只收费不检车，可能面临以下法律后果：

1. 罚款：根据违规行为的严重程度和造成的后果，市场监督管理部门可以对检测机构处以一定数额的罚款。

2. 责令整改：市场监督管理部门可以要求检测机构立即停止违规行为，并采取措施进行整改，以确保其服务符合相关法律法规的要求。

3. 吊销营业执照：对于严重违规或屡教不改的检测机构，市场监督管理部门有权吊销其营业执照，禁止其继续从事检测服务。

四、消费者权益保护

作为消费者，如果发现机动车检测机构存在只收费不检车的行为，可以向市场监督管理部门进行举报。市场监督管理部门在接到举报后，会依法进行调查处理，并保护举报人的合法权益。同时，消费者也可以要求检测机构退还已收取的费用，并赔偿因违规行为造成的损失。

总结与建议：机动车检测机构只收费不检车的行为是违法的，主要由市场监督管理部门进行处罚。作为消费者，如果发现此类违规行为，应及时向市场监督管理部门举报，并保护好自己的合法权益。如果您在交通运输领域遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。