车贷逾期三个月后还款，可能面临以下几种情况，具体需结合贷款合同条款和金融机构政策综合判断：

1. 信用记录受损
   根据《征信业管理条例》，金融机构会将逾期记录上报央行征信系统。逾期三个月属于严重逾期，即使后续还清欠款，该记录仍会保留5年，可能影响您未来申请信用卡、房贷、车贷等金融业务。部分金融机构可能将此类记录纳入“黑名单”，导致短期内无法获得贷款。

2. 违约金与罚息
   贷款合同通常约定逾期违约金（如未还本金的5%-10%）和罚息（日利率上浮30%-50%）。例如，若逾期本金为10万元，违约金可能达5000-10000元，罚息按日计算，三个月累计可能超过本金1%。需仔细核对合同条款，确认具体金额。

3. 车辆被拖走或处置风险
   若贷款合同中约定“连续逾期90天，金融机构有权收回车辆”，则逾期三个月后，车辆可能被拖走并拍卖。即使还清欠款，若车辆已被处置，您可能面临车款无法追回的风险。建议立即联系金融机构，确认车辆状态。

4. 法律诉讼风险
   金融机构可能依据《民事诉讼法》向法院起诉，要求您偿还剩余本金、利息、违约金及诉讼费用。若法院判决您败诉，您的财产（如房产、存款）可能被强制执行，甚至被列入“失信被执行人名单”，限制高消费。

建议行动步骤：

1. 立即联系金融机构：说明逾期原因，协商还款计划（如延长还款期限、减免部分违约金），争取不上报征信或撤销诉讼。
   
2. 保留还款凭证：通过银行转账或金融机构官方渠道还款，避免现金交易，确保有书面记录证明已还款。
   
3. 查询征信报告：通过央行征信中心官网或线下网点查询个人信用报告，确认逾期记录是否已更新。
   
4. 咨询法律专业人士：若车辆已被拖走或面临诉讼，可进一步向我咨询具体应对方案（如提出管辖权异议、申请调解等）。
   

温馨提示：车贷逾期后，金融机构的催收行为可能涉及骚扰（如频繁电话、上门催收），若遇到此类情况，可依据《治安管理处罚法》向公安机关报案。