如果发现检察院公诉人存在违法行为，可以从以下几个角度来处理：

1. 向检察院内部监督部门反映
   检察院内部设有纪检监察部门或检务督察部门，专门负责对检察人员违法违纪行为的监督和查处。你可以向这些部门提交书面材料，详细说明公诉人的违法行为（如徇私枉法、滥用职权、违规取证等），并提供相关证据。检察院会根据内部程序进行调查，并根据调查结果作出相应处理。

2. 向上一级检察院申诉
   如果对同级检察院的处理结果不满意，或者认为同级检察院存在包庇行为，可以向上一级检察院提出申诉。上一级检察院会重新审查案件，并监督下级检察院依法处理。

3. 向纪检监察机关举报
   如果公诉人的行为涉嫌违纪违法，还可以向当地的纪检监察机关（如纪委监委）举报。纪检监察机关有权对公职人员的违法行为进行调查，并根据调查结果给予党纪政务处分，甚至移送司法机关处理。

4. 通过法律程序维权
   如果公诉人的违法行为直接侵害了你的合法权益（如非法取证导致冤假错案），可以在刑事诉讼中提出排除非法证据的申请，或者在案件审结后通过国家赔偿、申诉等途径维护自己的权益。

温馨提示：在反映问题时，建议尽量提供详细的证据材料（如书面记录、录音录像、证人证言等），以便相关部门能够快速、准确地调查处理。如果你对具体操作流程或证据收集有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的情况提供更详细的指导。