结论：窝藏罪拘留三天是否会有案底，主要取决于拘留的性质以及后续的法律程序。一般来说，单纯的拘留三天，若未经过法院审判并认定为有罪，是不会直接留下犯罪案底的。但具体还需分情况讨论。
分析说明：
行政拘留：
- 如果这三天拘留是行政拘留，即公安机关依法对违反行政管理秩序的公民采取的限制其人身自由的惩罚措施，那么这通常不会留下犯罪案底。行政拘留属于行政处罚，其记录主要在公安机关留存，用于内部管理和必要的查询，对当事人的一般生活和工作不会产生重大影响。
刑事拘留：
- 如果这三天拘留是刑事拘留，即公安机关、人民检察院在刑事案件侦查过程中，对现行犯或重大嫌疑分子采取的临时剥夺其人身自由的强制方法，那么是否留下案底就取决于后续的法律程序。
- 若最终经法院审判没有被认定为有罪，则不会留下犯罪案底。
- 若经过侦查、审查起诉，最后被法院判决有罪，则会留下犯罪案底，这将对当事人及其子女在就业、参军、报考公务员等方面产生限制。
司法拘留：
- 司法拘留是人民法院对妨害民事诉讼、行政诉讼、刑事诉讼情节严重的人，在一定期间内限制其人身自由的一种强制措施。它不属于刑事处罚，因此不会留下犯罪案底。但相关记录会在相关司法机关留存。
特殊场景：
- 在窝藏罪的情境下，如果拘留三天后，案件进入刑事诉讼程序，并且最终被法院判决有罪，那么就会留下犯罪案底。这将对个人的声誉和未来的生活产生长远影响。
后续建议：
- 如果您或您身边的人因窝藏罪被拘留，建议尽快咨询专业律师，了解案件的具体情况和可能的法律后果。
- 在法律程序中，积极配合调查，如实陈述事实，避免因为不当行为而加重法律责任。
- 同时，也要关注自己的合法权益，确保在法律程序中得到公正对待。
法律背景：
- “案底”一般指的是犯罪记录，即个人因犯罪行为被判处的刑罚记录。它对于个人的就业、参军、报考公务员等方面可能会产生重要影响。
- 拘留分为行政拘留、刑事拘留和司法拘留三种，每种拘留的性质和后果都不同，需要根据具体情况来判断是否会留下案底。
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