房贷卡逾期是否会秒扣款，需分情况讨论：

1. 若房贷卡与还款账户为同一卡，且已签订自动扣款协议
   银行通常会在还款日当天或约定时间从该卡中自动扣款。若卡内余额充足，系统会按协议完成扣款；若卡内余额不足导致逾期，银行一般不会立即“秒扣”，但会在后续补足余额时优先扣划欠款（包括本金、利息、罚息等）。部分银行可能设置多次扣款尝试（如还款日次日、宽限期内等），具体以贷款合同约定为准。

2. 若房贷卡与还款账户分离（如绑定其他银行卡还款）
   逾期后，银行通常不会直接从房贷卡中扣款，而是通过短信、电话等方式催收。若借款人长期未还款，银行可能通过法律途径申请冻结借款人名下账户（包括房贷卡），此时卡内资金可能被划扣用于偿债，但这一过程需经过法院执行程序，并非“秒扣”。

3. 特殊情况：银行有权扣款的法定情形
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，若银行已通过诉讼获得生效判决并申请强制执行，法院可扣划借款人名下账户资金（包括房贷卡）。但这一过程需经过立案、审理、执行等法定程序，不会因单次逾期直接触发。

建议：

• 及时关注还款账户余额，避免逾期；
  
• 若已逾期，尽快与银行沟通补缴欠款，减少罚息和信用损失；
  
• 若收到法院执行通知，应积极配合处理，避免账户被冻结或划扣。
  

如有具体合同条款或银行操作疑问，可进一步向我咨询。