关于中医科使用协定处方是否违规的问题，这主要取决于具体的使用情境和相关法规的遵循情况。以下是对此问题的详细解答：
首先，我们需要明确“协定处方”的定义。协定处方通常指的是由医疗机构或专家团队根据临床经验和疾病特点，制定出的针对特定疾病或症状的固定处方。这种处方旨在提高诊疗效率，减少患者等待时间，并确保用药的规范性和一致性。
接下来，我们分析协定处方的合法性。根据国家中医药管理局综合司发布的《关于加强治疗新冠病毒感染中药协定处方和医疗机构中药制剂使用的通知》等相关文件，我们可以得知：
在特定情境下，协定处方是合法且被鼓励的：例如，在新冠病毒感染等公共卫生事件中，为了充分发挥中医药的特色优势，提高发热门诊的接诊能力，减少患者就诊时间，各省级中医药主管部门会组织专家制定治疗新冠病毒感染的中药协定处方，供省内中医医院使用。这种情况下，使用协定处方是合法且被鼓励的。
协定处方的使用需遵循相关法规：虽然协定处方在特定情境下是合法的，但其使用仍需遵循《中华人民共和国中医药法》、《中华人民共和国药品管理法》等相关法规。这些法规对医疗机构的制剂配制、使用、备案等方面都有明确规定。例如，医疗机构配制制剂（含中药制剂）需由省、自治区、直辖市药品监督管理部门负责审批和监管。
协定处方需确保患者知情同意：在使用协定处方时，医疗机构应确保患者充分了解处方的组成、功效、用法用量等信息，并取得患者的知情同意。这是保障患者权益的重要一环。
协定处方需动态调整和储备：医疗机构应根据临床需求和患者反馈，对协定处方进行动态调整和优化。同时，还需做好相关中药饮片的储备工作，以确保处方的有效供应。
总结来说：中医科使用协定处方并不一定违规，关键在于是否遵循了相关法规、是否确保了患者的知情同意、以及是否根据临床需求进行了动态调整和储备。在特定情境下（如公共卫生事件），使用协定处方甚至是合法且被鼓励的。但无论如何，医疗机构都应严格遵守相关法规，确保用药的安全性和有效性。