在签订土地流转合同时，建议直接签订三份原件，而不是签一份再复印两份。以下从法律和实践两个角度进行详细分析：
法律角度
原件的法律效力：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律规定，合同原件是证明合同关系存在及合同内容的最直接、最有力的证据。在发生纠纷时，原件的法律效力远高于复印件。
- 复印件在法律上通常被视为间接证据，其证明力较弱，且容易受到质疑。如果仅有一份原件，而其他方持有的是复印件，那么在纠纷解决过程中，复印件的持有者可能会面临举证困难的问题。
合同份数的约定：
- 合同双方可以在合同中明确约定合同的份数以及各方的持有情况。如果合同中明确约定了需要签订多份原件，那么各方应当按照约定执行。
- 即使合同中没有明确约定份数，从保障各方权益的角度出发，签订多份原件也是更为稳妥的做法。
实践角度
便于各方保存和查阅：
- 签订多份原件可以确保合同各方都能持有完整的合同文本，便于各方保存和查阅。这样，在需要时，各方可以迅速提供合同原件作为证据，避免因为找不到原件而陷入被动。
避免复印件的潜在风险：
- 复印件可能存在模糊、不清晰等问题，影响合同的阅读和理解。此外，复印件还容易被篡改或伪造，从而引发纠纷。
- 签订多份原件可以避免这些潜在风险，确保合同的真实性和完整性。
符合行业惯例和交易习惯：
- 在土地流转等涉及重大权益的交易中，签订多份原件是行业惯例和交易习惯。这样做有助于维护交易的稳定性和安全性，促进交易的顺利进行。
建议
- 在签订土地流转合同时，建议直接签订三份原件，并由合同各方分别持有。这样，在需要时，各方可以迅速提供合同原件作为证据，保障自己的合法权益。
- 如果确实无法签订多份原件，那么至少应当确保合同各方都能获得清晰的复印件，并在复印件上加盖与原件相符的印章或签字确认。同时，各方还应当妥善保管复印件，以备不时之需。
总之，从法律和实践的角度出发，签订多份土地流转合同原件是更为稳妥和安全的做法。如果你在签订土地流转合同过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。