手写的合作协议在符合法律规定的情况下，是具有法律效力的。以下从多个角度为你详细分析：

一、合同形式的有效性

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人订立合同可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式包括合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。手写合作协议作为书面形式的一种，只要其能够清晰地表现所载内容，即满足合同形式的要求，因此具备法律效力。

二、合同生效的要件

一个有效的民事法律行为（包括合同）必须满足以下条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：

   • 签订合作协议的各方当事人必须是年满18周岁且精神正常的自然人，或者是依法成立并具有独立法人资格的组织。只有具备相应民事行为能力的当事人才能够理解合同的性质、内容和后果，并独立表达自己的意思。

2. 意思表示真实：

   • 当事人在签订合作协议过程中，其表示出来的意思必须与其内心真实意愿一致。如果存在欺诈、胁迫等导致意思表示不真实的情形，受影响的当事人有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。

3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：

   • 合作协议的内容必须合法，不得违反国家法律法规的禁止性或限制性规定，也不得损害国家利益、社会公共利益或违背社会公德和善良风俗。否则，协议将被认定为无效。

三、手写合作协议的特殊性及建议

手写合作协议因其书写方式的特殊性，需要特别注意以下几点：

• 字迹清晰、表述准确：

  • 尤其是涉及到合作协议重要内容的部分，如合作事项、权利义务、违约责任等，应确保字迹清晰、表述准确，避免因书写错误或模糊不清而导致合同纠纷。

• 签字或盖章确认：

  • 手写合作协议应由各方当事人签字或盖章确认，以表明各方对协议内容的认可和接受。签字或盖章是合同成立和生效的重要要件之一。

• 考虑公证等额外措施：

  • 为进一步提高手写合作协议的安全性和可信度，建议在协议签订后去公证处进行公证。公证机关可以对协议的真实性、合法性进行审查，并出具公证书，为协议的履行提供更有力的法律保障。

四、实际案例与法律后果

在实际操作中，手写合作协议因字迹不清、表述模糊或未经签字确认等原因引发的纠纷并不少见。例如，某两人手写了一份合作协议，但因字迹潦草导致部分条款无法辨认，最终在合作过程中产生了争议。法院在审理此类案件时，往往会因协议内容不明确而难以作出准确判断，从而增加了当事人的诉讼风险和成本。

因此，在签订手写合作协议时，务必确保字迹清晰、表述准确，并由各方当事人签字或盖章确认。如有条件，还可以考虑进行公证等额外措施以增强协议的安全性和可信度。

如果你在签订或履行手写合作协议过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。