结论概述：小股东被申请执行，一般情况下不会直接影响公司股权结构，但在特定情形下，如小股东股权被强制执行或公司存在特殊约定时，可能会对公司股权产生影响。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下不影响公司股权结构
股权独立性：小股东的股权是其个人财产的一部分，与公司其他股东的股权相互独立。因此，小股东被申请执行，通常不会直接导致公司股权结构的变动。
执行程序限制：在执行程序中，法院通常只会针对被执行人的个人财产进行查封、冻结或拍卖等措施，而不会直接涉及公司股权的变动，除非该股权属于被执行人的个人财产且符合执行条件。
二、特定情形下可能影响公司股权
股权被强制执行：
- 情形描述：如果小股东持有的公司股权被法院认定为可执行财产，并依法进行拍卖或变卖，那么该股权的受让方将成为公司的新股东，从而可能导致公司股权结构的变动。
- 法律依据：根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》等相关法律法规，法院有权对被执行人持有的股权进行查封、冻结，并在符合条件时进行拍卖或变卖。
公司章程或股东协议特殊约定：
- 情形描述：如果公司章程或股东协议中存在特殊约定，如小股东被申请执行时其股权需转让给其他股东或公司，那么该约定可能在小股东被申请执行时触发，导致公司股权结构的变动。
- 法律建议：在制定公司章程或股东协议时，应充分考虑各种可能的情况，并明确约定相关条款，以避免未来可能出现的纠纷。
公司资本变动或股权结构调整：
- 情形描述：在小股东被申请执行期间，如果公司发生资本变动（如增资、减资）或股权结构调整（如股权转让、合并、分立等），那么该小股东的股权比例和权益可能会受到影响。
- 法律建议：公司在进行资本变动或股权结构调整时，应依法履行相关程序，并确保所有股东的权益得到充分保障。
三、法律建议与风险提示
小股东层面：
- 风险防范：小股东应合理规划个人财产，避免将过多资产投入公司股权，以降低被申请执行时的风险。
- 法律意识：增强法律意识，了解并遵守相关法律法规，避免因违法行为导致股权被强制执行。
公司层面：
- 章程设计：在公司章程中明确约定股权转让、被执行等情形的处理方式，以减少未来可能出现的纠纷。
- 股东沟通：加强股东之间的沟通与协作，共同维护公司股权结构的稳定。
总结与进一步思考：小股东被申请执行，在一般情况下不会直接影响公司股权结构。但在特定情形下，如股权被强制执行、公司章程或股东协议存在特殊约定，以及公司资本变动或股权结构调整时，可能会对公司股权产生影响。因此，无论是小股东还是公司，都应增强法律意识，合理规划财产和股权结构，以降低潜在风险。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。