农民的非基本农田耕地被挖，可采取以下措施来维护自身合法权益：

1. 立即制止并收集证据

   • 一旦发现耕地被非法挖掘，应第一时间制止侵权行为（在确保自身安全的前提下），防止损失进一步扩大。
   • 收集现场照片、视频，记录挖掘时间、地点、参与人员及设备信息，保留与侵权方沟通的录音、聊天记录等，这些证据对后续维权至关重要。

2. 确认土地性质与权属

   • 核实被挖耕地是否属于非基本农田（可通过当地国土资源部门查询土地规划用途），若土地性质无误，需确认自身是否持有合法的土地承包经营权证或土地使用权证，这是主张权利的基础。
   • 若土地权属存在争议（如与村集体、其他村民或第三方存在纠纷），需先通过行政确权程序明确权属，再追究侵权责任。

3. 向相关部门举报

   • 自然资源部门：非法挖掘耕地可能涉及破坏耕地、非法占地等违法行为，可向当地自然资源局（或国土资源局）举报，要求其立案查处并恢复土地原状。
   • 农业农村部门：若挖掘行为导致耕地质量严重下降（如破坏表层土壤、灌溉设施），可向农业农村局反映，要求对土地损毁程度进行鉴定并督促修复。
   • 公安机关：若挖掘行为涉嫌故意毁坏财物、非法占用农用地罪等刑事犯罪（如挖掘面积较大、造成严重后果），可直接向公安机关报案。

4. 协商或调解

   • 在证据充分的情况下，可尝试与侵权方直接协商，要求其停止侵害、赔偿损失（包括土地修复费用、农作物减产损失等）。
   • 若协商无果，可申请村委会、乡镇人民政府或人民调解委员会介入调解，通过第三方中立机构促成和解。

5. 提起民事诉讼

   • 若协商、调解均未果，可向法院提起民事诉讼，主张侵权方承担停止侵害、排除妨碍、恢复原状、赔偿损失等民事责任。
   • 诉讼中需重点证明：侵权事实（如挖掘行为与土地损毁的因果关系）、损失金额（可通过鉴定机构评估）及自身权属合法性。

6. 关注行政处理结果

   • 若已向自然资源部门举报，需跟进案件查处进度，要求行政部门对侵权方作出行政处罚（如罚款、限期恢复土地原状）。
   • 若对行政处理结果不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

温馨提示：耕地是农民的重要生产资料，非法挖掘行为可能同时触犯行政、民事甚至刑事法律。建议根据实际情况选择合适的维权路径，必要时可委托律师协助处理，以确保程序合法、证据充分，最大限度维护自身权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。