在人事争议纠纷案中，用人单位确实承担着重要的举证责任，但并非所有情况下都完全由用人单位举证，而是根据具体争议事项和法律规定来确定举证责任的分配。以下是对此问题的详细解析：
一、基本原则
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条的规定：“发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。”这一原则明确了在劳动争议中，用人单位对于其掌握和管理的证据负有举证责任，但同时也保留了“谁主张，谁举证”的一般原则。
二、用人单位的具体举证责任
劳动关系存在的证明：
- 用人单位应提供劳动合同、工资支付记录、考勤记录等证据，以证明与劳动者之间存在劳动关系。若未签订劳动合同，用人单位还需提供其他能证明劳动关系的材料，如工作证、服务证、招聘登记表等。
工资支付情况的证明：
- 用人单位应提供工资支付台账或清单，明确记载劳动者的工资数额、支付时间、支付方式等信息。工资支付台账至少需保存两年备查。
规章制度合法性的证明：
- 用人单位在制定、修改或决定直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应经过民主程序，并提供相关证据。规章制度的内容不得违反法律法规的规定。
解除或终止劳动合同的证明：
- 用人单位在解除或终止劳动合同时，应提供合法有效的证据，如解除劳动合同通知书、离职证明等。若因劳动者过错而解除劳动合同，用人单位还需提供劳动者存在过错的证据。
其他争议事项的举证：
- 对于加班工资、年休假工资等其他劳动争议事项，用人单位也应按照法律规定提供相应的证据。例如，对于加班工资的争议，用人单位需提供考勤记录、加班审批单等证据来证明劳动者的加班情况。
三、特殊情况下的举证责任倒置
在某些特殊情况下，法律会规定由用人单位承担举证责任，这被称为举证责任倒置。例如：
- 工伤认定：根据《工伤保险条例》第十九条，若职工或其近亲属认为是工伤，而用人单位不认为的，由用人单位承担举证责任。
- 计算劳动者工作年限、确认工资标准等：这些情况下，由于用人单位掌握着相关证据，因此法律要求用人单位承担举证责任。
四、用人单位未履行举证责任的后果
若用人单位未按照法律规定提供由其掌握管理的与争议事项有关的证据，或者提供的证据不足以证明其主张的，将承担不利后果。这可能导致用人单位在劳动争议中败诉，需要承担相应的法律责任和经济赔偿。
五、实践建议
证据收集与管理：
- 用人单位应规范档案管理，确保相关证据的完整保存与及时提供。劳动者也应保存工资条、考勤记录等原始证据。
法律风险防范：
- 用人单位应完善用工制度，及时签订书面合同，避免劳动争议的发生。劳动者可定期备份工作成果、沟通记录，以防证据灭失。
专业咨询：
- 在发生人事争议纠纷时，建议双方及时咨询专业律师（即我本人，李海峰律师，专注于工伤赔偿、社会保险领域），以获取更具体的法律建议和帮助。
综上所述，人事争议纠纷案中的举证责任并非完全由用人单位承担，而是根据具体争议事项和法律规定来确定。用人单位应充分了解并履行自己的举证责任，以维护自身合法权益并减少劳动争议的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。