店铺有纠纷时原则上可以转让，但需分情况讨论，且转让行为可能受到法律限制或需承担特定责任。具体分析如下：

1. 纠纷类型对转让的影响

   • 合同纠纷：若店铺存在未履行的合同（如租赁合同、供货合同），转让需经合同相对方（如房东、供应商）书面同意，否则可能构成违约，需承担赔偿责任。
     
   • 债务纠纷：若店铺有未清偿债务（如贷款、员工工资），转让后原店主仍可能被追偿，除非与债权人明确约定债务转移且获同意。
     
   • 侵权纠纷：如店铺涉及知识产权侵权、消费者权益纠纷，转让不影响原店主承担法律责任，新店主若明知仍接手可能承担连带责任。
     

2. 转让程序的合法性要求

   • 告知义务：转让时需向受让方如实披露纠纷情况，隐瞒可能导致合同无效或可撤销，原店主需赔偿受让方损失。
     
   • 手续完备：需办理工商变更登记、税务清算等手续，若因纠纷导致营业执照被吊销或查封，转让可能无效。
     

3. 风险防范建议

   • 纠纷解决前置：优先通过协商、调解或诉讼解决纠纷，再行转让，避免后续纠纷牵连新店主。
     
   • 协议约定：在转让合同中明确纠纷责任划分（如“原店主负责处理转让前纠纷，新店主不承担”），并留存书面证据。
     
   • 第三方担保：要求原店主提供担保（如押金、第三方保证），确保纠纷解决前受让方权益不受损。
     

总结：店铺有纠纷时转让需谨慎，建议先评估纠纷性质、解决可能性及法律风险，必要时委托律师起草转让协议并协助办理手续。若有具体纠纷场景，可进一步向我咨询细节。