结论：几十年前您家的猪圈建在别人院里，现在能否要赔偿需分情况讨论，主要取决于是否存在侵权行为、是否超过诉讼时效以及能否提供充分证据等因素。以下为您详细分析：
一、是否存在侵权行为
历史原因与现状：
- 如果几十年前您家猪圈建在别人院里是基于某种历史原因（如当时双方有口头协议、土地界限不清等），且现在该猪圈仍然存在，但对方从未提出异议，那么可能不存在直接的侵权行为。然而，如果对方现在提出异议，并主张您家猪圈占用了其土地，那么就可能涉及侵权问题。
- 如果当时建猪圈时未经对方同意，且现在对方明确表示反对，那么您家可能构成侵权，对方有权要求您家拆除猪圈或赔偿损失。
侵权行为的认定：
- 侵权行为的认定通常需要考虑行为的违法性、损害事实的存在、违法行为与损害事实之间的因果关系以及行为人的过错等因素。
- 在您的情况下，如果猪圈确实占用了对方的土地，且对方因此遭受了损失（如土地使用权的受限、土地价值的降低等），那么您家可能构成侵权。
二、诉讼时效问题
诉讼时效的规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
对您情况的影响：
- 如果几十年前您家猪圈建在别人院里时，对方就知道或应当知道其权利受到侵害，但一直未提出异议，那么现在可能已经超过了诉讼时效期间。在这种情况下，对方即使现在提出赔偿请求，也可能因诉讼时效已过而得不到法院的支持。
- 但是，如果对方在最近几年内才知道其权利受到侵害，或者存在其他导致诉讼时效中断或延长的情形，那么诉讼时效可能尚未届满，对方仍有权提起诉讼。
三、证据问题
证据的重要性：
- 在侵权纠纷中，证据是认定事实、划分责任的关键。如果您家主张不构成侵权或对方主张的赔偿金额过高，都需要提供充分的证据来支持自己的观点。
您可能需要的证据：
- 如果您家认为不构成侵权，可能需要提供当时建猪圈的合法依据（如土地使用证、双方协议等）、对方长期未提出异议的证据等。
- 如果对方主张赔偿，您家可能需要提供反驳对方主张的证据，如猪圈未占用对方土地的证据、对方损失不合理的证据等。
四、建议与措施
协商解决：
- 在双方争议不大且愿意和解的情况下，可以尝试通过协商解决纠纷。您可以与对方沟通，了解对方的诉求和底线，寻求双方都能接受的解决方案。
寻求法律帮助：
- 如果协商无果或对方态度强硬，您可以考虑寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为您提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助您维护自己的合法权益。
注意诉讼时效：
- 如果对方已经提起诉讼或您打算提起反诉，请注意诉讼时效的问题。确保在诉讼时效期间内提起诉讼或反诉，以免丧失胜诉权。
最后，几十年前您家猪圈建在别人院里现在能否要赔偿是一个复杂的问题，需要综合考虑多种因素。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。