在起诉法院确认劳动关系期间，工伤仲裁的时效主要受到仲裁时效的限制，而非诉讼时效（起诉时效）。以下是对这一问题的详细分析：
一、仲裁时效
一般规定：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。这一时效从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
- 在确认劳动关系的情境中，若劳动者认为用人单位未与其签订书面劳动合同或存在其他侵害其劳动关系权利的行为，劳动者应自知道或应当知道权利被侵害之日起一年内申请仲裁。
中断与中止：
- 中断：若因当事人一方向对方主张权利、向有关部门请求权利救济，或对方当事人同意履行义务，仲裁时效将中断，并从中断时起重新计算一年。例如，劳动者书面要求用人单位确认劳动关系，此时仲裁时效中断，从用人单位收到请求时起重算。
- 中止：因不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他正当理由导致无法按时申请仲裁的，仲裁时效中止，待阻碍因素消除后继续计算。
特殊情形：
- 劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效限制；但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
二、诉讼时效与仲裁的关系
- 在确认劳动关系的法律程序中，诉讼时效并非直接适用的概念。通常，劳动者需先经过劳动仲裁程序，对仲裁结果不服的，再向法院提起诉讼。
- 诉讼时效主要适用于民事权利受到侵害后，权利人在法定期限内不行使权利，导致债务人获得诉讼时效抗辩权的情形。但在确认劳动关系的仲裁案件中，当案件进入诉讼阶段后，法院主要对仲裁结果进行司法审查，并不直接适用民事诉讼中的诉讼时效制度。
三、实际操作建议
及时申请仲裁：
- 劳动者在知道或应当知道其劳动关系权利被侵害后，应尽快收集证据并申请仲裁，以避免超过仲裁时效。
注意中断与中止情形：
- 在仲裁时效期间内，若发生中断或中止情形，劳动者应及时采取措施保护自己的合法权益，如书面要求用人单位确认劳动关系、向有关部门请求权利救济等。
对仲裁结果不服的及时起诉：
- 若劳动者对仲裁结果不服，应在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
示例说明：
假设劳动者小李于2023年1月1日入职某公司，但公司一直未与其签订书面劳动合同。小李在2024年1月1日意识到自己的权利被侵害（即入职满一年时），此时仲裁时效开始起算。若小李在2024年12月31日之前申请仲裁确认劳动关系，则未超过仲裁时效；若超过此期限，且公司以超过仲裁时效为由进行抗辩，小李可能面临败诉的风险。
总结与提醒：
在起诉法院确认劳动关系期间，工伤仲裁的时效主要受到仲裁时效的限制。劳动者应充分了解并遵守仲裁时效的相关规定，及时提出申请，避免因超过时效而丧失法律保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。