当遇到运送标本丢失的情况时，这确实是一个需要严肃对待的问题，尤其是当涉及到高致病性病原微生物菌（毒）种或样本时。以下是我为您详细梳理的处理流程：
一、立即报告
内部报告：一旦发现标本丢失，应立即向本单位的相关负责人报告，确保信息在组织内部迅速流通。
政府报告：根据《病原微生物实验室生物安全管理条例》的规定，接到报告后，相关单位应在2小时内向本级人民政府报告，并同时向上级人民政府卫生主管部门或兽医主管部门，以及国务院卫生主管部门或兽医主管部门报告。这是为了确保政府能够及时了解情况，并采取必要的控制措施。
二、组织调查核实
成立调查组：相关单位应迅速成立调查组，对标本丢失的原因、过程、可能的影响等进行全面调查。
通知当事人：在调查过程中，应通知相关当事人到场，当场告知其采取强制措施的理由、依据以及依法享有的权利。同时，听取当事人的陈述和申辩，确保调查的公正性和全面性。
三、采取控制措施
封控决定：根据调查结果，如果认为有必要，应报经批准后作出行政强制决定，如封控相关区域、设备或人员等。
制作并交付封控决定书和清单：按照法定程序和要件，制作封控决定书和清单，并当场交付给相关当事人，确保其了解封控的具体内容和要求。
四、消除隐患与警告
消除隐患：根据《病原微生物实验室生物安全管理条例》的规定，相关单位应责令采取措施，消除因标本丢失可能带来的隐患，如加强实验室的生物安全管理、对相关人员进行培训等。
给予警告：对于未经批准运输高致病性病原微生物菌（毒）种或样本，或者承运单位未履行保护义务导致标本丢失的，应由县级以上地方人民政府卫生主管部门或兽医主管部门依照各自职责，给予警告。
五、后续处理与追责
后续处理：加强病原微生物实验室的日常监管，对发现的问题及时依法进行处置，确保类似事件不再发生。
追责：如果标本丢失造成了传染病传播、流行或其他严重后果，应依法对托运单位和承运单位的主要负责人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员给予撤职、开除的处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
六、免责情形
当然，如果存在《中华人民共和国公职人员政务处分法》、《四川省行政执法监督条例》等规定的免责情形，相关责任人员可能免于追责。但这需要严格的法律程序和证据支持。
总之，运送标本丢失是一个严重的问题，需要立即报告、组织调查、采取控制措施、消除隐患、给予警告，并在必要时进行追责。希望这些信息能够帮助您更好地理解和处理这类问题。