基本农田上一般不允许种树，这是为了严格保护国家粮食安全，确保耕地资源的可持续利用。以下从多个角度进行详细分析：
法律法规依据
《基本农田保护条例》：该条例明确规定，禁止任何单位和个人在基本农田保护区内进行破坏基本农田的活动，这其中包括建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物等，同时也明确禁止占用基本农田发展林果业和挖塘养鱼。这是因为基本农田是为确保国家粮食安全而划定的优质耕地，其主要功能是粮食等重要农产品的生产。
《关于防止耕地“非粮化”稳定粮食生产的意见》：该意见进一步强调了严格规范永久基本农田上的农业生产经营活动，明确禁止占用永久基本农田从事林果业以及挖塘养鱼、非法取土等破坏耕作层的行为。
《土地管理法》：该法也明确规定了永久基本农田经依法划定后，任何单位和个人不得擅自占用或者改变其用途，特别是禁止占用永久基本农田发展林果业。
种树对基本农田的影响
种树会改变基本农田的农业用途，影响耕地的耕种条件和土壤质量。树木的生长会破坏土壤的耕作层，降低土壤的肥力和透水性，从而影响粮食作物的生长。此外，种树还会占据原本用于粮食生产的土地资源，削弱基本农田生产粮食的能力，对国家的粮食供应和粮食安全构成潜在威胁。
现实情况与处罚措施
在实际操作中，对于农户小面积种植树木的行为，如果及时纠正，移走或清理掉树木，恢复原状，通常不会受到处罚。然而，如果农户不配合整改，拒绝清理树木，监管部门有权下发整改通知书，要求限期清理并恢复原状，并可能处以相应处罚。在严重情况下，如果构成犯罪，还会移交司法机关追究刑事责任。
特殊情况的考虑
虽然基本农田一般不可以种树，但在某些特殊情况下，如涉及土地利用总体规划的调整，并且经过依法批准改变了基本农田的用途，那么可能存在例外情形。但这种情况必须严格按照相关法律法规和政策要求来执行，且审批程序严格，需要确保不会损害国家粮食安全和耕地资源的可持续利用。
建议与行动
对于已经种植在基本农田上的树木，如果具有经济价值且移植可行，建议农户将其移植到一般耕地或荒山荒地中。这样既可以减少损失，又能避免违反法律法规。同时，农户应严格遵守相关法律法规，不在基本农田上种植果树或其他非粮食作物，以确保土地的合理利用和可持续发展。
综上所述，基本农田上一般不允许种树，这是为了保护国家粮食安全和耕地资源。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。