登记机关在判断一审判决书是否已经生效时，主要依据的是法律规定的上诉期限以及法院出具的生效证明。以下是对这一流程的详细解释：

首先，根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人如果不服地方人民法院的第一审判决，有权在判决书送达之日起十五日内向上一级人民法院提起上诉。这意味着，从判决书送达当事人之日起算，有十五天的上诉期。

如果在这个上诉期内，当事人没有提起上诉，那么一审判决书在上诉期届满后即发生法律效力。然而，仅仅依据判决书本身，登记机关是无法直接判断当事人是否已经提起上诉，以及判决书是否已经发生法律效力的。

为了解决这个问题，最高人民法院曾发布通知，明确要求原审人民法院在当事人未上诉的第一审离婚案件的离婚判决在上诉期届满发生法律效力后，应向当事人出具判决生效证明书，并加盖法院印章。这个生效证明书就是确认判决书已经发生法律效力的官方文件。

因此，当登记机关面对当事人持一审判决书来办理相关手续（如再婚登记）时，为了确认判决书的法律效力，会要求当事人提供法院出具的生效证明书。只有提供了这个证明书，登记机关才能确信判决书已经生效，并据此为当事人办理相关手续。

综上所述，登记机关判断一审判决书是否已经生效的主要依据是法院出具的生效证明书。这个证明书是确认判决书法律效力的官方文件，也是登记机关办理相关手续的必要依据。