根据我国《道路交通安全法》及《道路交通安全违法行为记分管理办法》的相关规定，对于公路客运车辆超载50%但不到100%的情形，处罚措施如下：

1. 罚款标准
   由公安机关交通管理部门对驾驶人处以500元以上2000元以下罚款。具体罚款金额由执法部门根据超载比例、违法情节及地方实施细则综合判定。

2. 记分处罚
   驾驶公路客运车辆载人超过核定人数50%以上未达100%的，一次记12分。根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，记满12分将面临驾驶证扣留、需参加满分学习及考试，合格后方可重新取得驾驶资格。

3. 其他后果

   • 车辆暂扣：公安机关交通管理部门可扣留机动车至违法状态消除（如卸载超载人员）。
     
   • 企业连带责任：若涉及营运单位，交通运输主管部门可对运输企业处以1000元以上5000元以下罚款，并责令整改。
     
   • 保险影响：超载行为可能导致保险公司拒赔或部分免赔，增加事故赔偿风险。

法律依据：

• 《道路交通安全法》第92条（客运车辆超载处罚）
  
• 《道路交通安全违法行为记分管理办法》第8条（记分规则）
  

建议：

1. 立即停止违法状态，安排合法车辆转运超载人员；
   
2. 主动配合执法部门处理，避免进一步处罚；
   
3. 若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
   

如有其他细节需进一步分析（如地方性法规差异、事故责任认定等），可直接向我咨询。