针对您提出的“已盖章的合同作废怎么处理”的问题，这是一个涉及合同法律效力和解除程序的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：

一、合同作废的法律基础

合同作废，在法律上通常指的是合同的终止或解除。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同可以通过约定解除、法定解除以及合同履行完毕自然终止等方式来作废。这些方式都明确了合同作废的条件和程序，确保了解除行为的合法性和有效性。

二、合同作废的具体方式

1. 协商一致解除

   • 操作要点：双方可以就合同作废进行协商，并达成书面协议。协议中应明确约定合同自何时起不再具有法律效力，同时详细说明原合同的基本信息、解除合同的原因和双方的意愿。这种方式需要双方达成一致，并形成书面文件作为证据。

2. 签订补充协议作废

   • 操作要点：如果双方希望保留原合同的部分条款或对废止后的相关事宜进行安排，可以签订一份终止原合同的补充协议。补充协议中应明确废止原合同的相关条款，并对废止后合同中未履行的和已经履行的内容做出妥善安排。

3. 约定解除条件成就

   • 操作要点：如果双方在原合同中约定了解除条件，当这些条件成就时，一方或双方可以按照合同约定行使解除权。主张解除合同的一方应及时书面通知对方，并留存通知送达的证据，以确保解除行为的合法性。

4. 法定解除情形

   • 具体情形：根据《民法典》的规定，包括因不可抗力致使不能实现合同目的、一方明确表示或以自己的行为表明不履行主要债务、一方迟延履行主要债务经催告后在合理期限内仍未履行等情形。在这些情况下，当事人可以依法解除合同。
   • 操作要点：当出现法定解除情形时，主张解除合同的一方应通知对方，并明确解除合同的原因和依据。合同自通知到达对方时解除，对方对解除有异议的，可请求人民法院或仲裁机构确认解除效力。

5. 合同无效

   • 具体情形：如果合同存在无民事行为能力人实施的民事法律行为无效、虚假意思表示实施的民事法律行为无效等情形，合同自始无效，无需专门“作废”。
   • 操作要点：在这种情况下，双方可以依据法律规定主张合同无效，并处理因此产生的相关事宜。

6. 诉讼或仲裁裁决

   • 操作要点：如果双方无法就合同作废达成一致，或者一方认为对方存在违约行为导致合同应作废，可以向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。法院或仲裁机构会根据具体情况作出判决或裁决，确定合同的效力及后续处理方式。

三、合同作废的注意事项

1. 遵循法律规定：在处理合同作废问题时，应严格遵守相关法律法规，确保解除合同的程序合法、有效。

2. 保留证据：在处理合同作废过程中，应注意保留相关的证据，如协商过程的记录、通知函、补充协议等。这些证据在后续可能出现的纠纷中具有重要的证明作用。

3. 诚实守信原则：双方应秉持诚实守信的原则进行协商和沟通，尽量规避不必要的法律风险。在解除合同过程中，应如实告知对方相关情况，并按照约定履行相关义务。

四、结论与建议

合同作废涉及双方的重大利益，应谨慎处理。在实际操作中，应根据具体情况选择合适的作废方式，并确保程序的合法性和有效性。如果您对合同作废的具体操作或法律后果存在疑问，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和指导。他们可以根据您的具体情况提供个性化的解决方案，并帮助您规避潜在的法律风险。