当股份公司董事会仅剩两人时，公司需根据《公司法》及公司章程的规定，及时采取措施以确保董事会的正常运作和公司的合规治理。以下是具体处理方式：

1. 补选董事以恢复法定人数
   根据《公司法》第111条，董事会会议应有过半数的董事出席方可举行。若董事会仅剩两人，虽未低于法定最低人数（3人非绝对限制，但需满足过半数出席要求），但已处于临界状态，任何一人缺席均会导致董事会无法开会。因此，首要措施是尽快召开股东大会补选董事，使董事会人数恢复至章程规定的合理范围（通常为3-19人，具体以章程为准）。补选程序需严格遵循公司章程关于董事选举的规定，包括提名、投票、计票等环节。

2. 若无法立即补选，可采取临时措施

   • 授权特定主体决策：若董事会因人数不足无法及时决策，可依据公司章程或股东会决议，临时授权董事长、总经理或其他高管在一定限额内行使部分董事会职权（如签署合同、审批预算等），但需明确授权范围、期限及责任，避免越权风险。
     
   • 召开临时股东会：若涉及重大事项（如合并、分立、解散等）需董事会决议但无法召开，可依据《公司法》第39条，由代表十分之一以上表决权的股东、三分之一以上董事或监事会提议召开临时股东会，直接由股东会作出决议。

3. 长期解决方案：修改公司章程
   若公司因规模缩小或其他原因需长期维持较小董事会规模，可通过股东会修改公司章程，降低董事会人数下限（但不得低于《公司法》规定的最低人数，即3人，但需注意部分特殊行业或地区可能有更高要求）。修改章程需经代表三分之二以上表决权的股东通过，并办理工商变更登记。

4. 风险提示与合规建议

   • 避免董事会长期无法运作：若董事会长期低于法定人数或无法召开会议，可能被认定为治理结构缺陷，影响公司融资、上市或合作，甚至引发监管处罚。
     
   • 完善决策机制：建议在公司章程中增加“董事会人数不足时的临时决策条款”，明确替代方案（如书面决议、视频会议等），确保紧急情况下决策效率。
     
   • 及时履行信息披露义务：若公司为上市公司或需公开披露信息的主体，董事会人数变动需按规则及时公告，避免信息滞后导致市场误解。

总结：董事会仅剩两人时，公司应优先补选董事；若无法立即补选，可通过授权、临时股东会等方式应急；长期可考虑修改章程；同时需注意合规风险，确保治理结构稳定。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询。