结论：醉驾检查院不起诉并不意味着案件完全结束，但通常不会留下案底，对后代的影响也相对有限。不过，具体情况还需根据不起诉的类型和原因来综合判断。

详细分析：

1. 不起诉的类型与影响：

   • 法定不起诉：如果检察院认为醉驾行为不构成犯罪，或者存在法定不起诉的情形（如犯罪嫌疑人已死亡、情节显著轻微等），则会作出不起诉决定。这种情况下，案件确实结束了，且不会留下案底。
   • 酌定不起诉：如果检察院认为醉驾行为虽然构成犯罪，但情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，也可以作出不起诉决定。这种情况下，虽然案件在法律上结束了，但可能仍会留下一定的记录，不过这种记录通常不被视为“案底”，对后代的影响也较小。
   • 证据不足不起诉：如果检察院认为现有证据不足以证明醉驾行为构成犯罪，也会作出不起诉决定。这种情况下，案件同样结束了，且不会留下案底。但需要注意的是，如果后续有新证据出现，检察院仍有可能重新提起公诉。

2. 案底的定义与影响：

   • 案底定义：案底通常指的是犯罪记录，即被法院判决有罪后留下的记录。不起诉决定并不等同于法院的有罪判决，因此通常不会留下案底。
   • 对后代的影响：即使留下了一定的记录（如酌定不起诉的情况），这种记录对后代的影响也相对有限。在大多数情况下，后代在升学、就业等方面不会受到直接影响。不过，如果后代从事某些特定职业（如公务员、军人等），可能会受到一定的限制或审查。

3. 特殊情况与建议：

   • 特殊情况：虽然不起诉通常不会留下案底，但在某些特殊情况下（如醉驾行为造成了严重后果、多次醉驾等），即使检察院不起诉，也可能对个人的社会信用、职业资格等产生一定影响。
   • 建议：无论是否留下案底，醉驾行为都是严重的违法行为，不仅可能危及自身和他人的生命安全，还可能对个人的未来产生长远影响。因此，我建议大家严格遵守交通法规，切勿酒后驾车。如果已经因醉驾行为面临法律问题，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并积极配合调查和处理。

后续行动建议：

• 如果您或您身边的人因醉驾行为面临法律问题，且检察院已经作出不起诉决定，但仍有疑虑或担忧，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。
• 如果您想了解更多关于醉驾行为的法律后果和防范措施，也可以随时向我提问，我会尽力为您解答。