关于机动车超载发生事故后保险公司是否赔偿的问题，这确实是一个需要综合考虑多方面因素的情况。以下是我为您详细梳理的解答：
一、总体原则
车辆超载是违反《道路交通安全法》的行为，它增加了交通事故的风险，并可能加重事故的损害后果。保险公司在设计保险产品时，会考虑各种风险因素，并据此制定保费和赔偿条件。因此，超载作为一种增加风险的行为，通常会在保险合同中有所体现，可能影响保险公司的赔偿决定。
二、交强险部分
交强险是由保险公司对被保险机动车发生道路交通事故造成的受害人（不包括本车人员和被保险人）的人身伤亡、财产损失，在责任限额内予以赔偿的强制性责任保险。
- 赔偿原则：交强险的设置旨在保障交通事故中受害人能获得基本的赔偿，具有较强的社会公益性。
- 超载与赔偿：通常情况下，汽车超载并不在交强险的免责范围内。即使车辆超载发生事故，对于交强险应赔偿的部分，保险公司仍会在责任限额内进行赔付。例如，因超载导致的碰撞事故造成第三方人员受伤和车辆损坏，保险公司会在交强险的各项赔偿限额内（如死亡伤残赔偿限额18万元、医疗费用赔偿限额1.8万元、财产损失赔偿限额0.2万元）对第三方受害人进行赔偿。
三、商业险部分
商业险的赔偿情况则相对复杂，通常需要根据保险合同的具体条款来确定。
可能赔偿的情况：
- 如果保险合同中没有明确将超载列为免责条款，那么保险公司通常需要在商业险范围内进行赔偿。
- 即使保险合同中有超载免责条款，但如果保险公司未对该条款尽到提示和明确说明义务，此时该免责条款不产生效力，保险公司仍需在商业险范围内赔偿。
可能拒赔或部分赔付的情况：
- 多数商业保险合同会将超载作为免责事由之一。当超载是导致事故发生的直接原因或重要原因时，且保险公司已对超载免责条款尽到了提示和明确说明义务，保险公司可能会拒绝赔偿商业险部分或实行一定比例的免赔率。例如，货车严重超载导致刹车距离过长而引发事故，保险公司可能会以超载为由拒赔或要求被保险人承担一部分损失。
- 保险公司需承担举证责任，证明超载与事故发生存在直接因果关系才能拒赔或部分赔付。
四、法律责任与建议
- 法律责任：即使保险公司因超载而拒赔或减少赔付，被保险人仍需承担因超载而造成的法律责任和损失，包括对其他受损方的赔偿责任及因违法行为而受到的行政处罚等。
- 建议：
- 驾驶者应严格遵守交通法规，不超载、不超速、不酒驾，确保行车安全。
- 在购买车险时，应仔细阅读保险合同条款，了解清楚保险公司的赔偿范围和免责条款，以便在发生事故时能够合理维护自己的权益。
- 如有疑问或不确定之处，建议咨询专业的保险代理人或法律顾问以获取准确建议。
综上所述，机动车超载发生事故后保险公司的赔偿情况需综合考虑交强险和商业险的合同约定及事故具体情况。驾驶者应遵守交规，谨慎驾驶，以确保自身和他人的安全。