结论前置：股东出资时未备注但持有出资证明书，在符合一定条件下，是可以被认可的。不过，具体是否有效还需结合实际情况和相关法律规定来判断。以下从多个角度进行分析：

1. 出资证明书的法律效力：

   • 出资证明书是公司向股东签发的证明股东已经履行出资义务的法律文件。它通常包含股东的姓名或名称、缴纳的出资额和出资日期等内容，是股东权益的重要凭证。
   • 根据《公司法》的相关规定，出资证明书应当由公司盖章，并载明特定事项，以证明股东的出资事实。因此，一份合法有效的出资证明书，本身就具有证明股东出资的效力。

2. 未备注出资的影响：

   • 出资时未备注，可能指的是在转账或支付出资时，未在备注栏明确标注“出资”或类似字样。这本身并不直接影响出资的效力，因为出资的认定主要依据的是出资证明书、公司章程、股东名册等法律文件，而非转账备注。
   • 然而，如果因为未备注而导致出资事实存在争议，比如公司或其他股东否认该笔款项为出资，那么股东可能需要提供其他证据来证明其出资事实，如转账记录、公司收款凭证、股东会决议等。

3. 出资证明书与其他证据的结合：

   • 在出资未备注的情况下，如果股东持有合法有效的出资证明书，并且能够提供其他辅助证据（如转账记录、公司财务记录等）来证明其出资事实，那么其出资应当被认可。
   • 如果出资证明书存在瑕疵（如未盖章、内容不完整等），或者股东无法提供其他辅助证据，那么其出资的认定可能会受到一定影响。

4. 法律建议：

   • 对于股东而言，在出资时应当尽量在转账备注中明确标注“出资”或类似字样，以减少后续可能出现的争议。
   • 同时，股东应当妥善保管出资证明书和其他相关证据，以备不时之需。
   • 如果因为出资未备注而导致出资事实存在争议，股东应当及时咨询专业律师，通过法律途径维护自己的合法权益。

举例说明：假设甲公司股东A向公司转账一笔款项用于出资，但在转账时未备注“出资”。后来，公司向A签发了出资证明书，并载明了A的姓名、缴纳的出资额和出资日期等内容。在这种情况下，尽管转账时未备注，但A持有的出资证明书仍然可以证明其出资事实。如果公司或其他股东否认A的出资，A可以提供转账记录、出资证明书等证据来证明自己的出资事实。

进一步思考：在实际操作中，股东出资的认定可能涉及多个方面和多个法律文件。因此，在处理类似问题时，应当综合考虑各种因素和相关法律规定，以确保出资的合法性和有效性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。