鉴定机构是可以接受当事人的笔迹鉴定委托的。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律依据与个人委托的合法性
根据相关法律法规，个人在面临民事纠纷（如合同纠纷、遗嘱继承纠纷等）时，若对相关文件上的笔迹真实性存在疑问，为了查明事实并维护自身合法权益，有权自行委托具有资质的司法鉴定机构进行笔迹鉴定。这一权利在法律规定和实践操作中均得到确认。
二、实际操作与注意事项
选择鉴定机构：
- 当事人在选择鉴定机构时，必须确保其具备合法的鉴定资质。可以通过查询相关机构的官方网站、咨询行业内的专业人士或参考相关部门的推荐来确认机构的资质。
- 鉴定机构应具有相应的业务范围，即能够从事笔迹鉴定工作。
提供鉴定材料：
- 当事人应提供真实、完整、充分的鉴定材料，包括需要鉴定的笔迹样本以及可能的对比样本。
- 当事人应对材料的真实性、合法性负责，以避免因材料问题导致鉴定结果无效或被质疑。
鉴定结果的认可与质疑：
- 虽然个人委托的鉴定结果在初步阶段能为当事人提供有力的专业意见支持，但在诉讼过程中，如果对方当事人对鉴定意见提出异议并申请重新鉴定，且该申请符合法定条件（如鉴定程序存在严重瑕疵、鉴定结论明显依据不足等），法院可能会准许重新鉴定。
- 因此，当事人在委托鉴定时应尽量确保程序的规范性和结果的准确性，以减少被质疑的可能性。
三、诉讼中的笔迹鉴定委托
- 除了个人直接委托外，当事人在民事诉讼中也可以主动申请法院进行笔迹鉴定。此时，由法院决定是否准许并委托相关机构进行鉴定。
- 法院委托的鉴定通常具有更高的权威性和公信力，因为法院会严格审查鉴定机构的资质和鉴定程序的合法性。
四、建议与总结
- 谨慎选择鉴定机构：当事人在选择鉴定机构时，应仔细核查其资质和业务范围，确保鉴定结果的合法性和有效性。
- 提供充分材料：委托鉴定时，应提供真实、完整、充分的鉴定材料，并对材料的真实性、合法性负责。
- 考虑诉讼需求：如果涉及诉讼，当事人应充分考虑对方当事人可能提出的异议和重新鉴定申请，做好相应的准备和应对。
- 咨询专业意见：在必要时，当事人可以咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保障。
综上所述，鉴定机构是可以接受当事人的笔迹鉴定委托的。但当事人在委托鉴定时应谨慎选择鉴定机构、提供充分材料，并考虑诉讼需求。如果你有任何关于笔迹鉴定或合同纠纷的法律问题，都可以直接向我咨询。