可以同时在两个个体工商户公司做员工，但需注意相关的法律风险和实际操作中的限制。
法律层面：
- 根据我国《劳动合同法》的相关规定，并未明确禁止劳动者同时在两个或两个以上的用人单位建立劳动关系。因此，从法律层面讲，同时在两个个体工商户公司做员工并不违反法律规定。
- 但需要注意的是，劳动者应确保与每个用人单位都签订了合法的劳动合同，并明确各自的工作内容、工作时间、劳动报酬等条款，以避免因劳动合同不明确而引发的纠纷。
实际操作中的限制：
- 时间冲突：如果两个个体工商户公司的工作时间存在冲突，劳动者可能无法同时履行两个劳动合同中的工作职责，这可能导致用人单位的不满和劳动关系的紧张。
- 保密和竞业限制：某些行业或公司可能存在保密协议或竞业限制条款，要求劳动者不得在同行业或具有竞争关系的公司兼职。如果劳动者违反了这些条款，可能会面临法律责任和经济赔偿。
- 社会保险缴纳：在我国，社会保险是由用人单位为劳动者缴纳的。如果劳动者同时在两个用人单位工作，需要确保社会保险的缴纳不会出现问题，如重复缴纳或漏缴等。
建议：
- 在决定同时在两个个体工商户公司做员工之前，劳动者应充分了解两个公司的工作时间、工作内容、劳动报酬以及是否存在保密和竞业限制等条款。
- 如果可能的话，劳动者可以与两个用人单位协商，签订灵活的工作合同，以确保能够同时履行两个劳动合同中的工作职责。
- 劳动者应密切关注社会保险的缴纳情况，确保自己的权益得到保障。
综上所述，虽然可以同时在两个个体工商户公司做员工，但劳动者需要充分了解相关法律风险和实际操作中的限制，并采取相应的措施来确保自己的权益和劳动关系的稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。