若交通事故已经了结，但之后其中一方鉴定出伤残，可按以下情况处理：

1. 若交通事故了结时已签订赔偿协议：

   • 协议具有法律效力：如果双方在交通事故了结时已经签订了赔偿协议，且该协议是双方真实意思的表示，不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议是具有法律效力的。
   • 伤残情况未预见：然而，如果当时签订协议时，受伤一方并未预见到自己会构成伤残，或者伤残情况并未显现，那么该协议可能存在重大误解或显失公平的情形。
   • 可请求撤销或变更协议：根据《民法典》的相关规定，因重大误解订立的合同，或者一方利用对方处于危困状态、缺乏判断能力等情形，致使民事法律行为成立时显失公平的，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销或变更。因此，受伤一方可以在知道或应当知道撤销事由之日起一定期限内（通常为一年），向法院或仲裁机构请求撤销或变更原赔偿协议，并要求对方按照新的伤残情况支付相应的赔偿。

2. 若交通事故了结时未签订赔偿协议，或协议未涵盖伤残赔偿：

   • 可另行提起诉讼：如果双方在交通事故了结时并未签订赔偿协议，或者协议中并未涵盖伤残赔偿的内容，那么受伤一方可以在鉴定出伤残后，另行向法院提起诉讼，要求对方支付伤残赔偿金等相关费用。
   • 需准备相关证据：在提起诉讼时，受伤一方需要准备相关的证据材料，如交通事故认定书、伤残鉴定报告、医疗费用发票等，以证明自己的伤残情况以及因此产生的损失。

3. 关于伤残鉴定的时机与程序：

   • 治疗终结后进行鉴定：伤残鉴定通常应在治疗终结后进行，以确保鉴定结果的准确性。如果受伤一方在交通事故后立即进行了鉴定，但之后病情发生变化或需要进一步治疗，那么可以在治疗终结后重新进行鉴定。
   • 选择正规鉴定机构：进行伤残鉴定时，应选择具有合法资质的正规鉴定机构，以确保鉴定结果的合法性和有效性。

行动建议：

• 及时咨询律师：面对这种情况，建议受伤一方及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律途径和赔偿标准。
• 保留相关证据：同时，应保留好所有与交通事故和伤残相关的证据材料，以便在需要时提供证明。
• 谨慎处理赔偿事宜：在处理赔偿事宜时，应谨慎对待赔偿协议的内容，确保自己的权益得到充分保障。如果可能的话，可以在律师的协助下签订赔偿协议。