集中采购代理机构受到警告处罚后，行政主管部门对责任人的处理需根据具体违法情形、责任大小及内部规定综合判定，可能包括警告、罚款、暂停执业资格、吊销执业资格或行政处分等措施。具体分析如下：

一、责任人处理的法律依据与原则

根据《中华人民共和国政府采购法》《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例，集中采购代理机构及其工作人员的违法行为需承担法律责任。行政主管部门对责任人的处理遵循“过罚相当”原则，即根据违法行为的性质、情节及社会危害程度，结合责任人的主观过错（故意或过失）确定处罚类型和幅度。

二、责任人处理的具体情形

1. 警告或罚款
   若责任人存在轻微违法行为（如未按规定发布采购公告、未妥善保存采购文件等），但未造成严重后果，行政主管部门可能对其单独或并处警告、罚款。例如，《政府采购法》第七十八条规定，采购代理机构违规的，可处二万元以上二十万元以下罚款，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处二千元以上二万元以下罚款。

2. 暂停或吊销执业资格
   若责任人存在严重违法行为（如与供应商串通、泄露采购秘密、索取或收受贿赂等），行政主管部门可暂停其执业资格3至6个月，或直接吊销其执业资格。例如，《招标投标法》第五十条规定，招标代理机构泄露保密资料的，可处五万元以上二十五万元以下罚款，对单位直接责任人员处单位罚款数额5%至10%的罚款；情节严重的，暂停直至取消招标代理资格。

3. 行政处分
   若责任人为国家机关工作人员（如政府采购中心的工作人员），行政主管部门可依据《公务员法》或《行政机关公务员处分条例》，对其给予警告、记过、记大过、降级、撤职或开除等处分。例如，若责任人因故意违规导致国家利益受损，可能面临撤职或开除处分。

三、责任认定的关键因素

1. 主观过错：责任人是否存在故意或重大过失（如明知违规仍操作）。
   
2. 违法行为与后果的关联性：责任人的行为是否直接导致采购结果无效、国家利益受损或供应商投诉。
   
3. 内部管理责任：若机构存在制度漏洞或管理失职，可能追究管理层责任。
   
4. 配合调查态度：责任人是否主动承认错误、配合整改或提供证据，可能影响处罚轻重。

四、实务建议

1. 机构层面：集中采购代理机构应建立合规管理体系，定期培训工作人员，明确操作规范，降低违法风险。
   
2. 责任人层面：若面临处罚，可主动配合调查、提交整改方案，争取从轻处理；对处罚不服的，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
   
3. 行政主管部门：处理时应严格遵循法定程序，保障责任人的陈述、申辩权，确保处罚公正。

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