针对环保督察整改中企业虚假整改的问题，处理方式需结合行政监管、刑事追责及民事赔偿等多维度法律手段，具体处理路径如下：
行政监管层面的处理
- 责令限期改正与行政处罚：根据《环境保护法》第六十条及《环境行政处罚办法》，环保部门可对企业虚假整改行为立案调查，责令限期完成真实整改，并处以罚款（如按日连续处罚、按违法所得倍数罚款）。若企业拒不改正，可进一步采取查封、扣押设备或停产整治等强制措施。
- 信用惩戒与联合惩戒：依据《企业环境信用评价办法（试行）》，将虚假整改企业纳入环境信用“黑名单”，实施限制贷款、禁止参与政府采购、提高排污费征收标准等联合惩戒措施，形成跨部门监管合力。
刑事追责层面的处理
- 污染环境罪的认定：若虚假整改导致污染物持续排放且符合《刑法》第三百三十八条“严重污染环境”标准（如排放重金属超标三倍以上、非法处置危险废物三吨以上等），企业直接负责的主管人员和其他责任人员可能被追究刑事责任，处三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
- 提供虚假证明文件罪的适用：若企业通过伪造监测数据、篡改自动监测设备参数等方式虚假整改，且涉及环境影响评价机构、监测机构等第三方出具虚假证明文件，情节严重的，相关机构及责任人可能构成《刑法》第二百二十九条“提供虚假证明文件罪”，处五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。
民事赔偿层面的处理
- 生态环境损害赔偿诉讼：根据《民法典》第一千二百二十九条及《生态环境损害赔偿管理规定》，省级、市地级政府或其指定部门可作为赔偿权利人，对虚假整改导致生态环境损害的企业提起民事诉讼，要求其承担修复责任或赔偿损失（包括应急处置费用、生态环境修复费用、生态环境服务功能损失等）。
- 环境公益诉讼的补充：若政府未及时启动赔偿程序，符合条件的社会组织（如环保NGO）可依据《环境保护法》第五十八条提起环境公益诉讼，要求企业停止侵害、修复环境并赔偿社会公共利益损失。
实务建议：企业应建立合规整改机制，明确整改责任人、整改方案及验收标准，避免“纸面整改”；监管部门需加强整改过程监督（如安装在线监测设备、委托第三方核查），并建立整改台账动态管理；若发现虚假整改线索，可通过行政举报、刑事控告或民事索赔等途径维护权益。
提示：具体案件处理需结合虚假整改的具体情节（如持续时间、污染后果、主观恶意等）及地方性法规，建议提供详细案情后进一步分析。