军队人员酒驾血液酒精含量达到90毫克/100毫升的，将同时面临军队内部纪律处分和地方刑事处罚，具体处理方式如下：

1. 地方刑事处罚
   根据《刑法》第133条之一及《车辆驾驶人员血液、呼气酒精含量阈值与检验》标准，血液酒精含量≥80mg/100ml即构成“醉酒驾驶机动车”，属于危险驾驶罪。

   • 量刑标准：拘役1-6个月，并处罚金（通常5000元起）。
     
   • 附加后果：吊销机动车驾驶证（5年内不得重考），若驾驶的是营运车辆则10年内不得重考；若造成事故致人重伤/死亡，可能升级为交通肇事罪或以危险方法危害公共安全罪，面临更重刑罚。

2. 军队内部纪律处分
   军队对酒驾行为实行“零容忍”，依据《中国人民解放军纪律条令》及《军队贯彻落实〈中国共产党纪律处分条例〉的补充规定》：

   • 处分类型：通常给予开除军籍处分（最严重情形），或降职（级）、撤职、记大过等处分，具体结合情节严重性（如是否造成事故、是否抗拒检查等）。
     
   • 附加影响：处分结果会记入个人档案，影响退役安置、优待待遇等；若为党员，还可能面临党纪处分（如开除党籍）。

3. 特殊情形说明

   • 职务影响：若酒驾者为军官或关键岗位人员，处分可能更严厉（如直接开除军籍）。
     
   • 地方与军队衔接：地方司法机关会将犯罪记录通报军队，军队依据通报启动内部处分程序，两者独立但并行。
     
   • 自首/立功情节：若主动投案、配合调查或有重大立功表现，地方刑罚可能从轻（如缓刑），但军队处分通常不会因此减轻。

建议：若涉及具体案件（如已收到地方或军队处罚通知），需结合案发细节（如是否在营区、是否执行任务等）进一步分析。可直接向我提供更多信息，我会从刑事与纪律双重角度为你详细解答。