当被告人因取保候审期限届满而取消取保候审后，后续的处理方式会依据案件的具体情况和相关法律规定来决定。以下是对此问题的详细解答：
一、解除取保候审与退还保证金
解除取保候审：
- 取保候审的最长期限不得超过十二个月。期限届满时，如果司法机关（公安机关、人民检察院、人民法院）经审查认为被告人不构成犯罪，或虽然构成犯罪但情节轻微不需要判处刑罚或免除刑罚，且在取保候审期间没有违反相关规定，案件已经侦查终结或审查完毕，那么会决定解除取保候审措施。
- 解除取保候审的程序包括：办案人员提出解除意见，经部门负责人审核后，由机关负责人决定并制作相关决定书和通知书，及时送达执行机关和被告人、保证人。执行机关随后通知被告人和保证人解除措施。
退还保证金：
- 如果取保候审时采用了保证金方式保证，那么在解除取保候审的同时，公安机关应制作退还保证金决定书，并通知银行如数退还保证金给被告人。
- 被告人需到银行领取退还的保证金。若在取保候审期间违反了规定，可能会面临保证金的部分或全部没收。
二、变更强制措施
情形：
- 若取保候审期限已满，但案件尚未办结，且被告人仍有社会危险性，司法机关可能会考虑变更为更严厉的强制措施，如监视居住或逮捕。
- 如果被告人在取保候审期间违反了规定，如未经批准离开居住地、干扰证人作证等，情节严重的，也可能会被变更为逮捕措施。
- 若被告人符合监视居住条件，如患有严重疾病、生活不能自理，怀孕或者正在哺乳自己婴儿的妇女等，可以变更为监视居住。
处理：
- 变更强制措施需依法办理相关手续，并确保程序的合法性与正当性。司法机关会综合考虑被告人的社会危险性、案件进展情况等因素来作出决定。
三、后续案件处理
撤销案件：
- 如果经侦查发现被告人无犯罪事实或存在《刑事诉讼法》第十六条规定的情形（如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪；犯罪已过追诉时效期限；经特赦令免除刑罚等），应撤销案件。
移送审查起诉：
- 对于犯罪事实清楚、证据确实充分的案件，司法机关会移送同级人民检察院审查决定是否提起公诉。此时，取保候审措施可能会根据新的诉讼阶段的需要进行调整。
不起诉或终止审理：
- 在审查起诉阶段，如果犯罪情节轻微且依法不需判处刑罚或免除刑罚，人民检察院可作出不起诉决定。
- 在审判阶段，如果人民法院认为被告人无罪或依法不应追究刑事责任，应作出无罪判决或终止审理的裁定。
总结与建议
取保候审期限届满后的处理需严格遵循法律规定，并根据案件具体情况作出相应决策。作为被告人，应遵守相关法律法规和取保候审的规定，配合办案机关的工作，并依法行使自己的权利。如果对处理结果有异议或需要法律帮助，建议及时咨询专业律师以获取更详细的指导和支持。