农民在自己土地上放集装箱是否违法，需根据土地性质、使用目的及是否履行审批手续等多方面因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、土地性质角度
农用地：
- 若土地为农用地，特别是耕地，其使用受到《土地管理法》等法律法规的严格保护和用途管制。在农用地上放置集装箱，如果并非用于农业生产设施建设相关的合理用途，而是用于居住、仓储等非农业活动，就属于擅自改变耕地用途，违反了土地管理的相关规定，可能构成违法建设。
- 即便集装箱是用于农业生产需要，如临时存放农具、农产品等，也必须按照规定进行审批，获得农业农村部门和自然资源部门的批准，并履行相应的备案等程序。未经合法审批手续，擅自在农用地上放置集装箱，同样属于违法建设行为。
宅基地：
- 若土地为宅基地，其用途主要是用于建造住宅及其附属设施。在宅基地上放置集装箱，如果用于居住、生产经营等合法用途，并且符合当地的城乡规划要求，不占用土地指标，且经过了相关部门的规划许可和审批，那么这种放置行为是合法的。
- 但若放置集装箱用于非宅基地规划用途，如未经批准的商业仓库，或影响农村整体规划的实施，破坏规划的整体性和协调性，或存在明显的安全隐患，如放置在消防通道上或结构不稳定，则可能构成违法行为。
二、使用目的角度
农业生产辅助设施：
- 如果集装箱的放置是直接服务于农业生产活动，如作为临时农具存放点、农产品简易存储点等农业生产辅助设施，并且符合当地关于农业设施用地的相关标准和要求，那么这种放置行为一般不被视为违建。但前提是不得破坏土地耕作层，也不得改变土地的基本用途，且需履行相关审批手续。
非农业生产用途：
- 若集装箱用于居住、商业经营等非农业生产用途，且未履行相关审批手续，则很可能被认定为违建。因为这种行为改变了土地的原有用途，破坏了土地的农业生产功能，还可能面临法律制裁。
三、审批手续角度
- 无论土地性质如何，放置集装箱前都应咨询当地相关部门，了解具体的政策和规定，并办理必要的审批手续。这些手续可能包括建设规划许可、临时用地审批等，具体取决于当地政策和土地性质。
- 未经批准擅自放置集装箱，即使初衷是合法的，也可能因违反法定程序而被认定为违建。
四、建议与结论
咨询当地部门：
- 在放置集装箱前，建议农民先咨询当地自然资源部门、农业农村部门或城乡规划部门，了解具体的法律法规和政策要求，以及是否需要办理相关审批手续。
遵守规定：
- 确保集装箱的放置符合土地性质、使用目的及审批手续的要求，避免擅自改变土地用途或违反城乡规划等行为。
合法合规使用：
- 如果集装箱的放置是合法的，应确保其使用过程中不破坏土地耕作层、不改变土地基本用途，并符合安全生产和环保要求。
综上所述，农民在自己土地上放集装箱是否违法，需根据具体情况判断。为确保合法合规，建议农民在放置集装箱前充分了解相关法律法规和政策要求，并咨询当地相关部门或专业人士的意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。