结论：员工在连锁药店分店关闭且未提前协商的情况下，不可以直接选择不上班。员工应通过合法途径维护自身权益，而非擅自停工。
法律背景与建议：
劳动合同的继续履行与变更：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同一旦签订，即具有法律效力，双方应严格履行。分店关闭并不直接导致劳动合同的终止，除非符合法定解除条件（如用人单位被依法宣告破产、吊销营业执照等）。
- 在分店关闭的情况下，用人单位应与员工协商变更劳动合同内容，如工作地点、工作岗位等。若协商不成，用人单位应按照法律规定支付经济补偿金后解除劳动合同，而非直接要求员工不上班。
员工擅自停工的法律后果：
- 若员工在未与用人单位协商一致的情况下擅自停工，可能构成旷工，违反用人单位的规章制度。根据规章制度，用人单位有权对旷工员工进行处罚，包括但不限于警告、罚款、解除劳动合同等。
- 此外，员工擅自停工还可能影响其获得经济补偿金或其他合法权益。因为经济补偿金的支付通常与劳动合同的解除原因和程序有关，擅自停工可能导致员工在劳动争议中处于不利地位。
合法维权途径：
- 员工在面对分店关闭且未提前协商的情况时，应首先与用人单位进行沟通，了解关闭原因、后续安排及劳动合同变更或解除的可能性。
- 若沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，寻求行政部门的帮助和调解。
- 同时，员工也可以依法申请劳动仲裁，通过法律途径维护自身权益。在劳动仲裁过程中，员工应提供充分证据证明用人单位的违法行为及自身损失，以便获得合理的经济补偿。
可能的情况与应对：
- 若用人单位提出合法解除劳动合同：员工应要求用人单位按照法律规定支付经济补偿金，并办理离职手续。
- 若用人单位未提出解除劳动合同但要求员工不上班：员工应拒绝并坚持要求继续履行劳动合同或协商变更劳动合同内容。若用人单位坚持要求员工不上班且不支付工资，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 若员工擅自停工后被用人单位处罚：员工应评估处罚的合法性和合理性。若认为处罚不当，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求撤销处罚并恢复劳动关系或获得相应赔偿。
总结与建议：
在面对连锁药店分店关闭且未提前协商的情况时，员工应保持冷静和理性，通过合法途径维护自身权益。擅自停工不仅可能违反用人单位的规章制度，还可能影响员工获得经济补偿金或其他合法权益。因此，建议员工在遇到此类情况时，及时咨询专业律师（如我赵亮华律师，专注于工伤赔偿、合同纠纷领域），了解自身权益和维权途径，以便做出明智的决策。