不是车主本人开车闯红灯，扣分将依据“谁违法、谁担责”的原则进行，具体扣分情况需根据交警现场查处或电子抓拍监控的实际情况来判断。以下是对此问题的详细分析：

一、交警现场查处的情况

• 扣分原则：若闯红灯行为被交警现场查处，扣分将直接针对当时的实际驾驶人，即非车主本人。这是因为交通违法行为的责任应当由实施该行为的人承担，与车辆的所有权无关。
• 法律依据：根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，驾驶机动车违反道路交通信号灯通行的，一次记6分。这一规定明确了闯红灯行为的扣分标准，且扣分对象是实际驾驶人。

二、电子抓拍监控的情况

1. 普通电子眼：

   • 特点：一般的电子眼没有人脸识别功能，仅抓拍汽车信息。
   • 扣分情况：若无法确定实际驾驶人，则通常使用车主的驾驶证进行扣分处理。但车主可提供证据（如行车记录仪视频等）证明实际驾驶人，经交警核实后，将对实际驾驶人进行扣分处罚。这体现了交通管理部门在无法确定实际驾驶人时，先以车辆所有人为处理对象，但允许车辆所有人提供证据进行申辩的原则。

2. 高清摄像头：

   • 特点：具备人脸识别功能，能清晰抓拍到驾驶人信息。
   • 扣分情况：电子眼抓拍违章时，明确识别到谁是驾驶人，就将对其直接进行处罚。处理违章时必须提供违法人的驾驶证，否则无法办理。这进一步强化了“谁违法、谁担责”的原则，确保了交通违法行为的责任能够准确落实到个人。

三、法律责任与罚款

• 记分处罚：根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，违反道路交通信号灯通行，一次记6分。这一记分将直接记录在实际驾驶人的驾驶证上，影响其驾驶资格和信用记录。
• 罚款处罚：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。这一罚款也是针对实际驾驶人进行的，与车辆所有权无关。

四、其他注意事项

• 驾驶证扣分限制：一个驾驶证在一个记分周期内只能为不同的三辆车扣分，否则将被纳入“涉嫌代替接受处理的重点人员名单”。这一规定旨在防止驾驶证被滥用或出租给他人进行违法处理。
• 车辆扣分限制：一辆车在一个记分周期内只能使用三个驾驶证进行扣分，否则同样会被纳入“涉嫌代替接受处理的重点人员名单”，并暂停其违章处理业务。这一规定与驾驶证扣分限制相呼应，共同维护了交通违法处理的公平性和严肃性。

总结与建议：

不是车主本人开车闯红灯时，扣分和罚款将根据实际驾驶人和具体的执法情况来确定。无论何种情况，驾驶人都应严格遵守交通规则，确保行车安全，避免不必要的法律后果。同时，车主也应妥善管理自己的车辆，确保在发生违法行为时能够及时提供证据，明确责任归属。如果您或您身边的人遇到了此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。