建筑排污系统不合格确实存在诉讼时效的问题。下面我将从多个角度为你详细分析：

一、诉讼时效的基本规定

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果建筑排污系统不合格给你造成了损失，你需要在知道或应当知道这一事实之日起三年内提起诉讼，否则可能会丧失胜诉权。

二、诉讼时效的起算点

1. 知道或应当知道权利受损时：诉讼时效一般从你知道或应当知道建筑排污系统不合格，并且因此受到损害时开始计算。例如，如果你在房屋交付后不久就发现排污系统存在问题，并且因此遭受了损失，那么诉讼时效可能从你发现问题的那一刻开始计算。

2. 特殊情况下的起算点：在某些特殊情况下，如建筑排污系统不合格导致你长期无法正常使用房屋，或者问题一直未得到解决，诉讼时效的起算点可能会有所不同。这需要根据具体情况来判断，并可能涉及法律上的专业判断。

三、诉讼时效的中断与延长

1. 诉讼时效的中断：在诉讼时效期间内，如果你向对方提出了赔偿要求，或者对方同意履行赔偿义务，或者你提起了诉讼或申请了仲裁等，诉讼时效可能会中断。中断后，诉讼时效期间会重新计算。

2. 诉讼时效的延长：在特殊情况下，如你因不可抗力或其他正当理由无法在诉讼时效期间内提起诉讼，法院可能会根据具体情况决定延长诉讼时效期间。

四、实际建议

1. 及时取证：如果你发现建筑排污系统不合格，应尽快收集相关证据，如照片、视频、检测报告等，以证明问题的存在和损失的大小。

2. 咨询专业律师：虽然我在这里为你提供了一些基本的法律知识，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，我建议你尽快咨询专业律师，以便更准确地了解你的权利和义务，以及可能的诉讼策略。

3. 考虑和解或调解：在提起诉讼之前，你也可以考虑与对方进行和解或调解。这可能会更快地解决问题，并减少诉讼成本和时间。

4. 注意诉讼时效：最重要的是，不要忘记诉讼时效的问题。如果你错过了诉讼时效期间，即使你有充分的证据和理由，也可能无法获得法院的支持。

总结来说，建筑排污系统不合格确实存在诉讼时效的问题。你需要根据具体情况来判断诉讼时效的起算点，并注意诉讼时效的中断与延长。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。