在向仲裁委员会仲裁立案时，如果起诉分公司，是可以同时追加总公司为当事人的，但具体情形需要分情况讨论：
分公司有独立财产与责任能力时：
- 如果分公司具有相对独立的财产和责任能力，能够独立承担民事责任，那么在仲裁立案时，你可以选择仅起诉分公司。但在此情况下，若你希望总公司也承担责任（例如，在分公司财产不足以清偿债务时），你需要在仲裁过程中或仲裁裁决后，通过法律程序追加总公司为共同被执行人或另行起诉总公司。不过，从仲裁立案的角度，直接同时将总公司和分公司列为被申请人可能面临程序上的挑战，因为仲裁通常基于双方之间的仲裁协议，若总公司未签署该协议，直接追加可能涉及仲裁协议效力及仲裁管辖权的问题。但实践中，若分公司与总公司的责任界限不清晰，或你基于策略考虑希望一次性解决纠纷，可以尝试在立案时一并提出，并说明理由，由仲裁委员会根据具体情况决定。
分公司无独立财产与责任能力，或需总公司承担连带责任时：
- 如果分公司没有独立的财产和责任能力，或者根据法律规定、合同约定或实际情况，总公司需要对分公司的债务承担连带责任，那么在仲裁立案时，你可以同时将总公司和分公司列为被申请人。这样做的好处是可以一次性解决纠纷，避免后续执行过程中的麻烦。在提出仲裁申请时，你需要明确说明总公司与分公司之间的关系，以及总公司应承担责任的理由和法律依据。
法律建议：
- 在准备仲裁申请时，务必收集并整理好相关证据：包括分公司与总公司的关系证明（如工商登记资料）、合同、交易记录、往来函件等，以证明总公司应承担责任的事实和法律依据。
- 考虑仲裁协议的范围：如果仲裁协议仅由分公司签署，而总公司未签署，那么在追加总公司为被申请人时，可能需要考虑仲裁协议对总公司的效力问题。这可能需要你提供额外的证据或法律依据来支持你的主张。
- 咨询专业律师：虽然我可以为你提供一般的法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在准备仲裁申请或追加当事人事宜上，建议你咨询专业律师，以确保你的权益得到充分保障。
可能后果：
- 如果仲裁委员会认为你的追加申请合理且符合法律规定，那么总公司将被正式列为被申请人，与分公司共同承担仲裁程序中的权利和义务。
- 如果仲裁委员会认为你的追加申请不成立或不符合法律规定，那么总公司将不会被列为被申请人，你可能需要通过其他法律程序来追究总公司的责任。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。