结论：众筹协议纠纷能否按借款合同纠纷处理，需根据众筹的具体模式、协议内容以及法律关系的本质来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
众筹模式与法律关系
股权众筹：在股权众筹中，投资者通过众筹平台投资于初创企业或项目，获得的是企业的股权或股份。这种情况下，投资者与筹资者之间形成的是股权投资关系，而非借贷关系。因此，股权众筹协议纠纷通常不能按借款合同纠纷处理。
债权众筹（或称为P2P借贷众筹）：在债权众筹中，投资者通过众筹平台向筹资者提供资金，筹资者承诺在一定期限内还本付息。这种情况下，投资者与筹资者之间形成的是借贷关系，与借款合同纠纷的法律关系本质相同。因此，如果债权众筹协议纠纷符合借款合同纠纷的构成要件，如存在借贷合意、资金交付、还款承诺等，那么可以按借款合同纠纷处理。
捐赠众筹与奖励众筹：捐赠众筹中，投资者出于慈善或公益目的向筹资者提供资金，不期望获得任何回报。奖励众筹中，投资者向筹资者提供资金，以换取筹资者提供的非金融性回报（如产品、服务等）。这两种众筹模式下，投资者与筹资者之间均不形成借贷关系，因此众筹协议纠纷不能按借款合同纠纷处理。
协议内容与法律适用
众筹协议的具体内容对法律关系的判断至关重要。如果协议中明确约定了借贷条款，如借款金额、利率、还款期限等，且这些条款符合借款合同纠纷的构成要件，那么该纠纷可以按借款合同纠纷处理。
如果众筹协议的内容模糊或存在歧义，导致无法明确判断法律关系时，可能需要结合众筹模式、交易习惯、行业惯例等因素进行综合判断。
法律建议与风险提示
对于投资者：在参与众筹前，应仔细阅读众筹协议，了解协议的具体内容、法律关系及风险。如果协议涉及借贷条款，应确保自己理解并接受这些条款，并保留好相关证据（如转账记录、协议文本等）以备不时之需。
对于筹资者：在发起众筹时，应明确众筹模式、法律关系及风险，并在协议中清晰约定。如果涉及借贷条款，应确保自己有能力履行还款义务，并遵守相关法律法规（如利率限制、信息披露等）。
纠纷处理：如果发生众筹协议纠纷，双方应首先尝试通过协商、调解等方式解决。如果协商无果，可以根据协议中的仲裁条款或争议解决方式选择仲裁或诉讼。在诉讼过程中，法院或仲裁机构将根据众筹模式、协议内容及法律关系等因素综合判断纠纷的性质及法律适用。
总结：众筹协议纠纷能否按借款合同纠纷处理取决于众筹的具体模式、协议内容以及法律关系的本质。在处理此类纠纷时，建议双方仔细审查协议内容、了解相关法律法规，并在必要时寻求专业法律帮助。如果你有任何具体的众筹协议纠纷问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。