违法占用农用地是一个严重的法律问题，其处罚措施依据相关法律法规，会根据违法情节的轻重进行相应的处理。以下是对违法占用农用地处罚措施的详细解答：
一、行政处罚
责令退还非法占用的土地：
- 县级以上人民政府自然资源主管部门会要求违法者将非法占用的农用地归还给原所有者或使用者，以恢复土地的原有归属和合法使用状态。
限期拆除或没收建筑物：
- 若在非法占用的农用地上新建了建筑物和其他设施，且这些建设不符合土地利用总体规划，自然资源主管部门将责令违法者在规定期限内自行拆除，以恢复农用地原状。
- 当违法占用农用地新建的建筑物和其他设施符合土地利用总体规划时，自然资源主管部门有权没收这些新建的建筑物和其他设施。
罚款：
- 非法占用土地的，罚款额为每平方米100元以上1000元以下，具体数额根据违法情节的严重程度、占用土地的面积及造成的损害等因素确定。
- 对于破坏种植条件或造成土地荒漠化、盐渍化的行为，罚款额会更高，为耕地开垦费的5倍以上10倍以下；若破坏的是黑土地等优质耕地，则会从重处罚。
- 非法占用永久基本农田发展林果业或挖塘养鱼的，逾期不改正的，也会按占用面积处耕地开垦费2倍以上5倍以下的罚款。
二、刑事责任
适用情形：
- 当违法占用农用地的行为触犯刑法，构成非法占用农用地罪时，将依法追究刑事责任。这通常涉及非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，且数量较大，造成农用地大量毁坏的情况。
量刑标准：
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百四十二条，犯非法占用农用地罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
- 具体来说，非法占用基本农田5亩以上或基本农田以外的耕地10亩以上，且造成种植条件严重毁坏或严重污染的，即属于此罪行。
三、其他处罚措施
责令限期改正或治理：
- 对于破坏种植条件或造成土地荒漠化、盐渍化的行为，相关部门会责令违法者限期改正或治理，以恢复土地的生产能力。
行政处分：
- 若违法占用农用地的主体是国家机关工作人员，除接受上述行政处罚外，还会依法给予行政处分，包括警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等。
四、典型案例参考
- 某企业未经批准擅自占用农用地建设厂房，被责令退还土地、限期拆除厂房并恢复土地原状，同时处以每亩500元的罚款。
- 村民李某未经批准擅自占用基本农田8亩用于建设养殖设施，造成基本农田种植条件严重毁坏，被判处有期徒刑一年并处罚金2万元。
综上所述，违法占用农用地将面临严厉的法律制裁，包括行政处罚、刑事责任以及其他多种处罚措施。这些措施共同构成了保护耕地资源、维护国家粮食安全和生态安全的法律体系。因此，建议广大民众和企业严格遵守相关法律法规，切勿违法占用农用地。