核心结论：遇到还款日凌晨自动扣款但钱仍在逾期栏的情况，首先需确认扣款是否成功，再根据不同情况采取相应措施，包括联系银行或贷款机构、保留证据、关注信用记录等。以下是具体分析：

1. 确认扣款是否成功
   尽管钱显示在逾期栏，但需第一时间通过银行流水、扣款短信或贷款机构APP确认款项是否已被实际划扣。若扣款成功但未及时更新账户状态，可能是系统延迟导致，通常1-3个工作日内会恢复正常显示。
   操作建议：立即登录银行网银或贷款机构平台，查看交易明细；若未显示扣款，需进一步排查原因。

2. 联系银行或贷款机构核实情况
   若确认扣款失败，需立即联系银行或贷款机构客服，说明情况并要求人工核查。可能的原因包括：

   • 账户余额不足：扣款时账户资金不足，导致失败；
     
   • 银行系统故障：如系统维护、网络问题等导致扣款指令未执行；
     
   • 贷款机构系统错误：未正确发送扣款指令或更新账户状态。
     操作建议：要求客服提供扣款失败的书面证明（如截图、回执），并明确后续处理流程（如重新扣款时间、逾期记录修正等）。

3. 保留证据，避免被动
   无论扣款是否成功，均需保留以下证据：

   • 扣款前账户余额截图；
     
   • 扣款失败的短信或APP通知；
     
   • 与银行/贷款机构的沟通记录（通话录音、聊天记录等）。
     作用：若因系统问题导致逾期记录，这些证据可用于后续申诉或维权。

4. 关注信用记录，及时修正
   若扣款成功但逾期记录未消除，需向贷款机构提出书面异议，要求其向征信机构（如央行征信中心）申请修正。根据《征信业管理条例》，机构需在20日内回复处理结果。
   操作建议：通过贷款机构官网或APP提交异议申请，并附上扣款成功证明；若机构未及时处理，可向当地银保监会或征信中心投诉。

5. 预防类似问题再次发生

   • 提前存入足够资金：在还款日前1-2日确保账户余额充足；
     
   • 开通还款提醒：通过短信、APP推送等方式接收还款通知；
     
   • 手动还款备用：若自动扣款不稳定，可在还款日当天手动操作还款。

总结：此类问题通常由系统延迟或操作失误导致，关键是通过及时沟通、保留证据、关注信用记录来化解风险。若处理过程中遇到机构推诿或信用记录未修正，可进一步向我咨询具体维权步骤。