针对不同市里的县与县土地边界争议，通常应由县级以上人民政府负责处理，具体流程和单位可能因地区和争议性质有所不同，但一般可遵循以下途径：
协商解决：
- 争议双方首先可以尝试通过友好协商的方式解决边界争议。这种方式成本较低，效率较高，且有助于维护双方的关系。在协商过程中，可以邀请当地村委会、乡镇政府或相关部门的代表作为见证人，以确保协商的公正性和有效性。
向乡镇政府或县级政府申请调解：
- 如果协商无果，争议双方可以向争议所在地的乡镇政府或县级政府提出调解申请。这些政府机构通常设有专门的土地管理部门或调解委员会，负责处理此类争议。在调解过程中，政府机构会组织双方进行听证，了解争议的具体情况，并提出调解方案。
向市级或省级政府申请行政裁决：
- 如果乡镇政府或县级政府的调解未能成功解决争议，争议双方可以向市级或省级政府申请行政裁决。行政裁决是政府对争议事项作出的具有法律效力的决定，双方必须遵守。在申请行政裁决时，需要提交详细的争议材料和证据，以便政府机构能够全面了解争议情况并作出公正裁决。
法律途径：
- 如果行政裁决也未能解决争议，或者争议双方对行政裁决结果不满，可以通过法律途径解决。这通常包括向人民法院提起行政诉讼，要求法院对争议事项进行审理并作出判决。在诉讼过程中，需要提交充分的证据来支持自己的主张，并遵守法院的诉讼程序和规定。
在处理此类争议时，还需要注意以下几点：
- 保留证据：在争议发生前或发生过程中，应尽可能保留与争议相关的证据，如土地权属证书、土地使用协议、现场照片、视频等。这些证据在后续的协商、调解、行政裁决或诉讼过程中都将起到至关重要的作用。
- 了解相关法律法规：在处理土地边界争议时，应了解并遵守相关的法律法规，如《土地管理法》、《确定土地所有权和使用权的若干规定》等。这些法律法规为争议的处理提供了明确的法律依据和程序规定。
- 寻求专业帮助：如果争议复杂或涉及金额较大，建议寻求专业律师或土地管理专家的帮助。他们可以提供专业的法律意见和解决方案，帮助争议双方更好地维护自己的合法权益。
最后，需要强调的是，土地边界争议的处理需要耐心和细心。由于争议往往涉及双方的切身利益，因此处理过程中需要充分考虑双方的诉求和利益平衡。如果遇到难以解决的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。