股东会不能直接否定董事会的决议，但可以通过特定途径间接影响或促使董事会重新审议相关决议。以下是对此问题的详细分析：
一、股东会与董事会的职权划分
股东会职权：
- 股东会作为公司的最高权力机构，主要负责决定公司的重大方针和政策，如经营方针和投资计划、选举和更换董事和监事、审议批准公司的财务预算和决算方案、利润分配和弥补亏损方案等。
- 股东会还对公司增加或减少注册资本、发行公司债券、合并、分立、解散、清算或变更公司形式等重大事项作出决议，并有权修改公司章程。
董事会职权：
- 董事会作为公司的执行机构，负责召集股东会会议并向股东会报告工作，执行股东会的决议。
- 董事会还决定公司的具体经营计划和投资方案，制订公司的财务预算和决算方案、利润分配和弥补亏损方案等。
- 董事会还负责决定公司内部管理机构的设置，聘任或解聘公司经理及其报酬事项，并制定公司的基本管理制度。
二、股东会对董事会决议的间接影响方式
通过诉讼程序撤销违法违规的董事会决议：
- 如果股东认为董事会的决议内容违反法律、行政法规或公司章程，或者决议的程序违反法律、行政法规或公司章程，股东可以自决议作出之日起六十日内，请求人民法院撤销该决议。
- 这种撤销权是股东的法定权利，而非股东会的直接职权。股东需要通过提起诉讼的方式行使这一权利，从而间接影响董事会的决议。
通过修改公司章程限制董事会的职权：
- 股东会有权修改公司章程，从而间接影响董事会的职权范围。例如，股东会可以在章程中规定某些重大事项必须由股东会决议，而不得授权给董事会。
- 通过这种方式，股东会可以间接地对董事会的决策进行限制和监督。
通过选举或更换董事来影响董事会的决策：
- 股东会有权选举和更换非由职工代表担任的董事。通过选举支持自己立场的董事进入董事会，股东可以间接影响董事会的决策方向和结果。
- 如果股东对董事会的某项决议不满，他们可以通过选举新的董事来改变董事会的组成，从而影响未来的决策。
三、实际操作中的注意事项
- 遵守法律和公司章程：在实际操作中，股东会和董事会都应严格遵守公司章程和相关法律法规的规定，确保各自独立行使其职权。
- 保持沟通与协作：股东会和董事会之间应保持密切的沟通与协作，共同推动公司的健康发展。股东会应尊重董事会的专业决策，而董事会也应及时向股东会报告工作并接受监督。
- 谨慎行使权利：股东在行使撤销权或通过其他方式影响董事会决议时，应谨慎行事，确保自己的行为符合法律和公司章程的规定，避免给公司带来不必要的损失。
总结来说，虽然股东会不能直接否定董事会的决议，但可以通过诉讼程序撤销违法违规的决议、修改公司章程限制董事会的职权或通过选举或更换董事来影响董事会的决策。在实际操作中，股东会和董事会应相互尊重、密切协作，共同推动公司的健康发展。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。