多个村的经济联合社入股所形成的公司性质，需结合具体入股方式、公司章程及实际运营情况综合判断，常见性质如下：

1. 农民专业合作社（若符合合作社特征）
   若多个村的经济联合社以成员身份入股，且公司以服务成员为宗旨、谋求共同利益，符合《农民专业合作社法》中“自愿联合、民主管理”的特征（如成员以土地经营权、资金等入股，按交易量返还盈余），则该公司可能被认定为农民专业合作社。此类合作社属于互助性经济组织，具有法人资格，成员以其账户内记载的出资额和公积金份额为限承担责任。

2. 有限责任公司或股份有限公司（若符合公司法特征）
   若经济联合社以法人身份入股，且公司章程明确股东权利义务、按出资比例分配利润（如各村联合社按约定比例持有股权、参与决策），则该公司可能被认定为普通有限责任公司或股份有限公司。此时公司性质为营利性法人，股东以其认缴的出资额或股份为限承担有限责任。

3. 集体所有制企业（若保留集体经济属性）
   若入股后公司仍由村集体实际控制（如股权集中于村集体、收益用于村公共事务），且符合《乡村集体所有制企业条例》中“生产资料归集体所有、实行共同劳动”的特征，则可能被认定为集体所有制企业。此类企业属于非公司制法人，财产归属村集体所有，收益分配需经村民会议或村民代表会议决定。

关键判断因素：

• 入股主体身份：经济联合社是作为成员（自然人或法人）入股，还是以集体资产整体入股？
  
• 公司章程约定：利润分配方式（按出资比例还是交易量）、决策机制（一股一票还是一人一票）是否符合合作社或公司法要求？
  
• 实际运营目的：是否以服务成员为主（如提供农资采购、农产品销售服务），还是以营利为主（如投资商业项目、对外经营）？
  

建议：若需明确公司性质，需结合具体入股协议、公司章程及工商登记信息综合分析。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律定性。