在您所描述的情况下，即妻子出轨，男方作为原告起诉离婚，法院的判决会是一个综合考量的过程，主要依据《中华人民共和国民法典》的相关规定来进行。以下是对此问题的详细解答：
一、是否准予离婚
根据《民法典》第一千零七十九条，法院在审理离婚案件时，会首先进行调解。若夫妻感情确已破裂，且调解无效，法院将准予离婚。妻子出轨作为过错行为，若男方以此为由主张双方感情破裂，并经过法院调解仍无法挽回，法院大概率会判决准予离婚。特别是当妻子长期与他人保持不正当关系，严重伤害夫妻感情时，法院通常会认定感情已经破裂，从而支持离婚的请求。
二、子女抚养权归属
不满两周岁的子女：原则上由母亲直接抚养，但若母亲存在不宜抚养子女的情形，如患有久治不愈的传染性疾病等，而父亲请求直接抚养，法院也可能判给男方。
已满两周岁的子女：法院会根据双方的具体情况，遵循最有利于未成年子女的原则进行判决。虽然妻子出轨不必然导致其丧失抚养权，但在同等条件下，考虑到孩子的生活环境和依赖程度，以及父母双方的抚养能力，法院会做出综合判断。
已满八周岁的子女：应尊重其真实意愿。如果孩子明确表示愿意跟随某一方生活，法院在判决时会充分考虑这一意愿。
三、财产分割
在财产分割方面，法院会按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行判决。由于妻子出轨属于过错方，男方有权请求损害赔偿。具体分割时，法院可能会酌情对无过错的男方予以适当照顾，使其分得更多财产。同时，男方还可以就妻子的出轨行为主张精神损害赔偿，赔偿数额由法院根据妻子过错程度、对男方精神伤害大小等因素确定。
四、特殊情况下的考量
出轨程度与证据收集：出轨的程度，如偶尔的暧昧还是长期的同居，以及是否有确凿的证据，如照片、视频、聊天记录等，都会影响法院的判决。因此，在起诉前，男方应尽可能收集充分的证据来支持自己的主张。
双方协商与调解：在离婚过程中，双方可以尝试通过协商达成和解协议，包括财产分割、子女抚养等方面的安排。如果双方能够达成一致意见，法院通常会尊重双方的意愿并据此作出判决。这有助于减少诉讼成本和时间，同时也有利于维护双方的尊严和隐私。
五、综合考量与公正判决
值得注意的是，妻子出轨并男方起诉离婚并不意味着妻子在所有方面都会受到不利判决。法院在审理案件时会秉持公正、公平的原则，综合考虑夫妻感情是否破裂、子女的抚养问题、财产的分割以及双方的实际情况等多种因素。因此，每个案件的具体判决结果都会有所不同，需要具体问题具体分析。
综上所述，如果您面临此类问题，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。律师可以根据您的具体情况，提供针对性的法律策略，确保您的合法权益得到充分保护。