销售劣药的违法所得计算，主要依据的是行为人因实施违法行为所获得的全部收入，且一般不扣除成本。以下是对此问题的详细解析：
一、违法所得的定义
根据《中华人民共和国药品管理法》及相关法律法规，违法所得是指行为人因实施违法行为所获得的全部收入。在销售劣药的情境中，这通常指的是销售劣药所取得的全部销售收入，包括药品本身的价格以及可能因销售劣药而额外获得的费用（如运输费、包装费等，若这些费用已包含在销售款项内）。
二、违法所得的计算方法
直接法：
- 定义：通过查证销售记录、收款凭证等直接证据，确定销售劣药的具体金额。
- 适用情况：适用于有完整销售记录和收款凭证的案件。
- 示例：若某药店销售了价值8万元的劣药，且有相应的销售记录和收款凭证，则这8万元即为违法所得。
间接法（推定法）：
- 定义：当无法直接获取销售记录或收款凭证时，通过其他相关证据进行推定。
- 适用情况：适用于销售记录不完整或无法获取的情况。
- 具体方法：
- 根据进货价格、销售价格及库存数量推算销售金额。
- 参考同类产品的市场价格和销售情况。
- 结合行为人的供述和其他证人证言。
- 示例：若某药店的劣药进货价格为每盒40元，市场售价为每盒80元，且库存减少数量为150盒，但无具体销售记录，则可推定其违法所得为150盒×80元/盒=12,000元。
混合法：
- 定义：结合直接法和间接法的优点，对部分有直接证据的销售金额采用直接法计算，对无直接证据的部分采用间接法推定。
- 适用情况：适用于部分销售记录完整，部分销售记录缺失的案件。
三、计算过程中的注意事项
证据收集与审查：
- 确保所有用于计算违法所得的证据均合法、有效。
- 对证据的真实性、关联性和合法性进行严格审查。
合理扣除成本的问题：
- 一般原则：在计算违法所得时，一般不扣除成本。因为销售劣药本身就是违法的，其成本不应被扣除，这是为了严厉打击违法行为，维护市场秩序和消费者权益。
- 特殊情况：在某些极其特殊且法律有明确规定的情况下，可能需要考虑扣除与违法行为直接相关的某些特定成本（但这种情况非常罕见，且需严格依据法律规定）。然而，在大多数销售劣药的案件中，这一原则并不适用。
专业评估与鉴定：
- 对于复杂或争议较大的案件，可聘请专业机构进行评估或鉴定。
- 专业机构的意见可作为法院认定违法所得的重要参考。
遵循法律程序：
- 计算过程应遵循法定程序和证据规则。
- 确保当事人的合法权益得到保障，如知情权、申辩权等。
四、法律后果
销售劣药是严重的违法行为，不仅会对患者的身体健康造成危害，还会破坏药品市场的正常秩序。因此，对于销售劣药的行为，我国法律将给予严厉的打击和处罚，包括但不限于追缴违法所得、罚款、吊销许可证等行政处罚；构成犯罪的，还应依法追究刑事责任。
总结来说，销售劣药的违法所得计算应遵循相关法律法规的规定，确保计算的准确性和公正性。同时，执法机关也应加强调查取证工作，严厉打击销售劣药的违法行为。如果您有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询。