结论：公司章程原则上不可以约定只给企业法人分红而将自然人分红留在公司，这样的约定可能因违反法律强制性规定或公平原则而无效。不过，具体还需结合公司实际情况、章程约定内容以及相关法律法规进行综合判断。
分析说明：
公司分红的基本原则：
- 根据《公司法》的相关规定，公司分红是股东基于其出资比例或公司章程另有约定而享有的权利。分红应当遵循公平、公正的原则，确保所有股东按照其出资比例或约定比例获得相应的分红。
公司章程的约定限制：
- 公司章程是公司内部的“宪法”，对股东、公司、董事、监事、高级管理人员等具有约束力。然而，公司章程的约定不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得损害股东的合法权益。
- 若公司章程约定只给企业法人分红而将自然人分红留在公司，这种约定可能因违反公平原则或损害自然人股东的合法权益而被认定为无效。因为分红是股东的基本权利之一，公司章程无权剥夺或限制自然人股东的分红权。
特殊情况下的考虑：
- 如果公司章程中的约定是基于某种特殊目的（如为了公司的长期发展、避免资金外流等），并且这种约定得到了所有股东的一致同意，同时不违反法律、行政法规的强制性规定，那么这种约定可能是有效的。但这种情况非常特殊，且需要严格的法律程序和证据支持。
- 另外，如果自然人股东同意将其分红权转让给企业法人或放弃分红，并且这种转让或放弃是出于自愿、公平、合法的原则，那么这种安排也是可能的。但同样需要严格的法律程序和证据支持，以确保其合法性和有效性。
法律建议：
- 对于公司而言，在制定或修改公司章程时，应充分考虑所有股东的合法权益，确保分红条款的公平性和合法性。避免制定可能损害股东利益的条款，以免引发法律纠纷。
- 对于股东而言，如果发现公司章程中的分红条款存在不公平或违法的情况，应及时与公司协商修改或寻求法律救济。同时，在签订股东协议或公司章程时，应仔细阅读条款内容，确保自己的权益得到充分保障。
可能后果：
- 如果公司章程中的分红条款被认定为无效，那么公司可能需要按照法律规定的出资比例或实际约定比例向所有股东进行分红。这可能导致公司资金的外流和财务状况的恶化。
- 如果股东因分红条款不公平或违法而提起诉讼，公司可能需要承担法律责任和诉讼费用。这不仅会影响公司的声誉和形象，还可能对公司的经营和发展造成不利影响。
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