非法营运学生且超载6人的行为，将面临行政处罚和可能的刑事处罚，具体处罚措施需根据超载比例、是否造成严重后果等因素综合判断。以下从行政处罚和刑事处罚两个角度进行详细分析：
行政处罚
非法营运的处罚：
- 根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条的规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，由县级以上地方人民政府交通运输主管部门责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
- 在您描述的情况中，若非法营运行为被查实，将面临上述罚款等行政处罚。
超载的处罚：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条的规定，公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款；超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货的，处五百元以上二千元以下罚款。
- 超载6人，具体罚款数额需根据车辆额定乘员数来确定超载比例。若超载比例达到或超过百分之二十，则将面临五百元以上二千元以下的罚款。
- 此外，根据相关规定，驾驶公路客运车辆以外的其他营运客车载人超过核定人数未达20%的，或者驾驶其他载客汽车载人超过核定人数20%以上的，均会面临相应的罚款和记分处罚。对于非法营运的车辆，超载的处罚可能会更加严厉。
刑事处罚
危险驾驶罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条之一的规定，从事校车业务或者旅客运输，严重超过额定乘员载客，或者严重超过规定时速行驶的，构成危险驾驶罪，处拘役，并处罚金。
- 在您描述的情况中，若超载比例达到“严重超过额定乘员载客”的标准（通常认为超过额定乘员50%以上或者超过7人以上），则可能构成危险驾驶罪，面临拘役和罚金的刑事处罚。
交通肇事罪：
- 若非法营运且超载的行为导致交通事故，造成人员伤亡或财产损失，且行为人负事故主要或全部责任的，还可能构成交通肇事罪，面临更严厉的刑事处罚。
综合建议
- 立即停止非法营运行为：避免继续违法，减少法律风险。
- 积极配合调查：若已被相关部门查获，应积极配合调查，如实陈述事实，争取从轻处理。
- 咨询专业律师：在面临法律处罚时，建议咨询专业律师，了解具体法律后果和应对策略，以维护自身合法权益。
非法营运学生且超载6人的行为性质严重，不仅违反了道路运输管理法规，还违反了道路交通安全法规，甚至可能构成犯罪。因此，务必严格遵守相关法律法规，确保行车安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。