五座车超员一人的处罚标准为：处以200元以上500元以下罚款，并扣3分。以下是详细分析：

1. 法律依据
   根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条及《道路交通安全违法行为记分管理办法》（公安部令第163号）第十一条规定：

   • 驾驶校车、公路客运汽车、旅游客运汽车以外的其他载客汽车（包括五座车）载人超过核定人数未达20%的，一次记3分，并处200元以上500元以下罚款。
     
   • 五座车核定人数为5人，超员1人即超过核定人数20%（1/5=20%），但根据司法实践中的执法标准，超员1人通常按“未达20%”的最低档处罚（部分地区可能严格按20%以上处理，需结合地方细则）。

2. 处罚的合理性说明

   • 超员行为会显著增加车辆制动距离、降低操控稳定性，尤其在紧急情况下易引发群死群伤事故。法律通过记分和罚款的双重手段，旨在强化驾驶人对载客数量的重视。
     
   • 罚款幅度（200-500元）和记分分值（3分）的设定，综合考虑了违法行为的危害性、社会普遍性及执法可行性。

3. 特殊情形提示

   • 若超员人员为儿童（含婴儿），仍需计入核定人数。例如，五座车坐4个成人+1个婴儿，同样构成超员。
     
   • 在高速公路或城市快速路上超员的，部分地区可能从重处罚（如罚款上限提高至500元）。
     
   • 若因超员导致其他违法行为（如遮挡号牌、闯红灯），将数罪并罚。

建议：超员不仅面临法律处罚，更关乎生命安全。出行前应合理规划人数，避免因小失大。如有其他交通法律疑问，可直接向我咨询。