在刑事案件中，尸检是一个至关重要的环节，它对于确定死亡原因、查明案件事实具有不可替代的作用。关于尸检由哪个部门进行，这主要取决于案件的性质、法律规定以及实际操作的便利性。以下是对这一问题的详细解答：

一、主要尸检部门

1. 公安机关的法医鉴定机构：

   • 在刑事案件中，公安机关的法医鉴定机构是尸检的主要承担者。这些机构拥有专业的法医技术人员和先进的检验设备，能够全面、系统地检查尸体，确定死因、死亡时间及方式等关键信息。
   • 公安机关的法医鉴定不仅为案件的侦查提供了科学依据，还是确保司法公正和准确性的重要环节。

2. 司法鉴定机构：

   • 经司法行政部门严格审核登记，并取得《司法鉴定许可证》的司法鉴定机构，同样具备进行尸检并出具报告的资格。特别是那些具有法医病理鉴定资质的机构，在民事纠纷（如医疗纠纷中的死因争议）及当事人自行委托鉴定等场合下发挥着重要作用。
   • 司法鉴定机构的工作必须遵循严格的程序和规范，以确保鉴定结论的科学性、公正性和准确性，为后续的法律程序提供有力的证据支持。

二、特殊情况下的尸检参与人员

• 在特殊情况下，如涉及特定领域或复杂疾病的尸体检验，且缺乏专业法医资源或案件有特殊需求时，经过司法机关认可，具有相应专业知识和技能的医师也可参与尸检工作。他们主要协助法医进行尸检分析，提供专业意见。

三、尸检过程与家属权益

• 尸检过程需遵循严格程序和规定，包括通知家属到场、记录勘验检查情况、由参加勘验检查的人和见证人签名或盖章等，以确保公正性和透明度。
• 家属在尸检过程中享有知情权、观察权和保存义务。他们有权了解尸检的过程和结果，可以委派代表观察尸检过程，以监督尸检的公正性和透明度。同时，在尸检报告出来前，家属应当以书面形式要求尸检部门妥善保存死者的器官标本，以便将来对尸检结论不服时申请复核。

四、总结与建议

• 综上所述，刑事案件中的尸检工作主要由公安机关的法医鉴定机构负责，他们凭借专业的医学知识和技能为案件的侦查和审判提供关键证据。
• 在特殊情况下，具有相关专业知识的医师也可参与尸检工作。
• 家属在尸检过程中应积极行使自己的权益，确保尸检的公正性和准确性。
• 如果您对尸检过程或结果有任何疑问或不满，建议及时咨询专业律师或相关机构，以维护自己的合法权益。